Local elektrochemical detection of the hybridisation of complementary oligonucleotides on micro-structured surfaces

• Applicant: Professor Dr. Wolfgang Schuhmann
• Subject Area: Organic Molecular Chemistry - Synthesis and Characterisation
• Term: from 2003 to 2006
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5409547

• Final Report Year: 2007

Final Report Abstract

In dem Antrag zu dem Forschungsprojekt hatten wir folgende Forschungsansätze vorgeschlagen: Untersuchung und Optimierung der kovalenten Anbindung von Oligonukleotiden an Thiol-modifizierte Goldoberflächen. Mikrostrukturierung thiol-modifizierter Goldoberflächen zur Generation lateral unterschiedlicher Oberflächenbereichen in μm-Dimensionen. Herstellung von Oligonukleotid-Mikroarrays durch lokale chemische Modifikation vorstrukturierter Oberflächenbereiche mit DNA-Fragmenten. Visualisierung der Hybridisierung komplementärer DNA-Fragmente auf Thiol-modifizierten Goldoberflächen mittels hochauflösender SECM. Visualisierung der Hybridisierung komplementärer DNA-Fragmente auf Thiol-modifizierten Goldoberflächen mittels AC-SECM. In-situ Temperaturerhöhung bis zum Schmelzpunkt von Oligonukleotid-Doppelsträngen unter simultanen Beobachtung modifizierter Oberflächenbereiche im SECM; Detektion von Mismatches und Single Nucleotid Polymorphism (SNP). Es konnten alle vorgeschlagenen Arbeiten durchgeführt werden.

Publications

• Angew. Chem. Int. Ed. 43 (2004), 3482-3485
  F. Turcu, A. Schulte, G. Hartwich, W. Schuhmann
  
• Biosensors & Bioelectronics 20 (2004), 925-932
  F. Turcu, A. Schulte, G. Hartwich, W, Schuhmann
  
• Macromol. Rapid Communication 26 (2005), 325-330
  F. Turcu, G. Hartwich, D. Schäfer, W. Schuhmann
  
• Electroanalysis 18 (2006), 1916-1928
  M. Maciejewska, D. Schäfer, W. Schuhmann
  
• Biosensors & Bioelectronics 22 (2007), 1887-1895
  D. Schäfer, M. Maciejewska, W. Schuhmann
  
• Electroanalysis 19(2007), 318-323
  M. Etienne, P. Dierkes, T. Erichsen, W. Schuhmann, I. Fritsch,