Identifizierung von Proteinen, die mRNA-Identität an eine RNA verleihen

• Applicant: Privatdozent Dr. Sebastian Ulbert
• Subject Area: Cell Biology
• Term: from 2003 to 2006
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5412287

Die in der DNA gespeicherte genetische Information jeder Zelle dient in Form von Boten- oder messenger RNA (mRNA) als Bauplan für die Synthese von Proteinen. Da sich die Chromosomen der eukaryotischen Zelle im Zellkern befinden, die Proteinsynthese aber im Cytoplasma stattfindet, muß die mRNA aus dem Kern exportiert werden. Dasselbe gilt für andere Arten von RNA, die alle im Zellkern produziert werden, aber ins Cytoplasma gelangen müssen. Die verschiedenen Arten von RNA verlassen den Kern durch Interaktion mit unterschiedlichen, aber spezifischen Exportproteinen. Der jeweilige Transportweg ist entscheidend für das weitere Schicksal der RNA in der Zelle, jedoch ist noch weitgehend unbekannt, wie die Transportmaschinerie des Zellkerns die einzelnen RNAs unterscheidet. Am kritischsten ist die Differenzierung von mRNA und den small nuclear RNAs (U snRNAs), die, trotz vieler Gemeinsamkeiten in ihrer Biosynthese, auf vollkommen unterschiedlichen Exportwegen den Kern verlassen. Im hier beschriebenen Forschungsvorhaben sollen Proteine identifiziert werden, die mit den RNAs wechselwirken und diese für den mRNA Exportweg kennzeichnen. Ich möchte modifizierte Formen der U snRNAs, die wie mRNAs transportiert werden, zur Charakterisierung dieser Identitäts-Elemente benützen. Die ribonukleären Partikel (RNPs), welche die modifizierten U snRNAs enthalten, sollen gereinigt und die Proteinkomponenten mittels Massenspektroskopie identifiziert werden. Die gefundenen Proteine sollen auf ihre Rolle im RNP-Aufbau und im RNA-Export hin untersucht werden. Darüber hinaus möchte ich analysieren, wie Proteine, die mRNA-Identität verleihen, den Zugang der RNA zu anderen Exportwegen verhindern.

• DFG Programme: Research Fellowships
• Cooperation Partner: Professor Dr. Iain W. Mattaj