Kreuzkorrelation von Proteinbindetaschen zum Erkennen verwandter Bindungsepitope, unerwarteter Nebenwirkungsprofile und funktioneller Verwandtschaften

• Applicant: Professor Dr. Gerhard Klebe
• Subject Area: Bioinformatics and Theoretical Biology
• Term: from 2004 to 2013
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5430258

Im Rahmen des beantragten Projektes sollen Proteine aufgrund ihrer bekannten (experimentell bestimmen) räumlichen Struktur mit computergestützten Verfahren auf Bindestellen mit ähnlicher geometrischer und physikochemischer Struktur untersucht werden. Ziel der Untersuchungen ist es, Hinweise auf bisher unbekannte funktionelle Verwandtschaftsbeziehungen zwischen nicht-homologen Proteinen zu erhalten. Darüber hinaus sollen mögliche Kreuzreaktivitäten von Proteinen erkannt werden, die die Ursache unerwünschter Nebenwirkungen von Medikamenten darstellen könnten. Ein weiteres Ziel besteht darin, Hinweise für die Entwicklung neuer Wirkstoffe zu erhalten, indem in dem vorhandenen Datenmaterial nach günstigen Ligand-Fragmenten für die Bindung an bestimmte Teile einer Bindetasche gesucht wird.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Person: Professor Dr. Eyke Hüllermeier