Die Funktion einzelner Aminosäuren bei der Interaktion von Transmembranhelices

• Applicant: Professor Dr. Dirk Schneider
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2004 to 2011
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5435276

Die Faltung und Interaktion von Transmembranproteinen ist bis heute kaum verstanden und grundlegende Untersuchungen liegen zur Zeit nur für wenige Modellproteine vor. In diesem Antrag schlagen wir Untersuchungen vor, die die Rolle einzelner Aminosäuren bei der Interaktion einzelner Transmembranhelices und bei der Funktion eines ganzen Membranproteins näher definieren sollen. Experimentelle Grundlage der Untersuchungen ist ein von uns entwickeltes bakterielles "Two-Hybrid"-System, welches eingesetzt werden kann, um die heterotypische Interaktion von Transmembrandomänen zu untersuchen. Das System soll eingesetzt werden, um aus einer Bibliothek von Transmembranhelices mit zufälliger Sequenz interagierende Paare zu identifizieren, und diese identifizierten Paare sollen anschließend detaillierter charakterisiert werden. Außerdem soll die spezielle Rolle polarer Interaktionen in Membranproteinen untersucht werden und der Einfluss von Ca-Wasserstoffbrückenbindungen bei der Helix-Helix-Interaktion und bei der Funktion eines Membranproteins soll beschrieben werden. Ergänzend soll versucht werden, durch Kopplung von Topologie- und Interaktionsstudien ein einfaches 3DModell eines Membranproteins zu erhalten.

• DFG Programme: Research Grants