Evolutionary and functional genomics of Drosophila gene expression

• Applicant: Professor Dr. John Parsch
• Subject Area: Developmental Biology
• Term: from 2004 to 2008
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5436493

Neuere Fortschritte in genomischen Techniken ermöglichen globale Analysen von innerartlichen, individuellen Unterschieden in der Expression von Genen. Erste, überraschende Befunde deuten an, dass in vielen Arten (darunter Hefe, Drosophila, Menschen) große Unterschiede in der Genexpression bestehen. Zum Beispiel zeigen 40% aller Gene bei D. melanogaster individuelle Expressionsunterschiede. Das Ziel dieses Projekts ist die evolutive und funktionelle Analyse von Genen, die signifikante Expressionsunterschiede zwischen Linien von D. melanogaster zeigen. Die spezifischen Teilziele sind wie folgt: (1) Populoationsgenetische Analyse von "Kandidaten-Genen" um festzustellen, ob Expressionsunterschiede mit der Segregation von Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) korreliert sind, (2) Zwischenartlicher Vergleich von Kandidaten-Genen zur Frage, ob Gene mit großen Expressionsunterschieden innerhalb von Populationen auch erhöhte Raten molekularer Evolution zeigen, und (3) Funktionelle Analyse vermuteter cis-reglulatorischer Sequenzen, um SNPs zu identifizieren, die für inter-allergische Expresssionsunterschiede verantwortlich sind.

• DFG Programme: Research Grants
• Participating Person: Dr. Tina Hambuch