Signalstrukturen der enteroviralen Replikation und Translation: Interaktion des humanen Poly(rC)-bindenden Proteins 2 mit Enterovirus-RNA

• Applicant: Privatdozent Dr. Roland Zell
• Subject Area: Virology
• Term: from 2004 to 2009
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 5439225

Unter den Enteroviren haben die Coxsackieviren der Gruppe B (CVB) als Erreger akuter und chronischer Herzerkrankungen eine besondere klinische Relevanz. Die 5'-nichttranslatierten Region (5'-NTR) ihres Positivstrang-RNA-Genoms trägt essentielle Signalstrukturen für die Initiation der Replikation und der cap-unabhängigen Translation. Einige dieser Signalstrukturen sind an RNA-Protein-Interaktionen beteiligt. Die Bindung des humanen Poly(rC)-bindenden Protein 2 (PCBP2) an die RNA-Domänen I und IV der 5'-NTR führt zum Umschalten von viraler Translationsinitiation auf Initiation der viralen RNA-Synthese. Zwei KH-Domänen des PCBP2 binden an die virale RNA. Dieser Erkennungs-mechanismus ist derzeit ungeklärt. Ziel des Forschungsvorhabens ist die detaillierte Charakterisierung dieser RNA-Domänen und ihrer RNA-Protein-Komplexe. Qualitative und quantitative Bindungsstudien in vitro und Translationstests in Zellkulturen sollen zur biochemisch-funktionellen Analyse eingesetzt werden. Mittels Flüssigphasen-NMR-Spektroskopie soll die Raumstruktur einer ausgewählten RNA-Domäne und ihres Proteinkomplexes bestimmt werden. Erstmals soll "magic angle spinning"-Festkörper-NMR-Spektroskopie für Strukturuntersuchungen an RNA weiterentwickelt und angewandt werden.

• DFG Programme: Research Grants