Strukturelle Dynamik von RNA-bindenden Proteinen in biomolekularen Kondensaten

• Antragsteller: Dr. Christian Felipe Pantoja Rivillas
• Fachliche Zuordnung: Biophysik ; Strukturbiologie
• Förderung: Förderung seit 2025
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 556451152

Biomolekulare Kondensate spielen eine wesentliche Rolle bei der Organisation und Funktion von Zellen. Biomolekulare Kondensate, die in erster Linie aus RNA-bindenden Proteinen (RBPs) und RNA bestehen, können die strukturellen Eigenschaften der rekrutierten Moleküle verändern. Die Charakterisierung von strukturellen Veränderungen in Biomolekülen auf atomarer Ebene, hervorgerufen durch die spezifischen Bedingungen in Kondensaten, bleibt jedoch eine Herausforderung. Die Kernspin-Magnetresonanz (NMR) Spektroskopie hat sich als eine leistungsfähige Methode erwiesen, die eine solche Charakterisierung auf atomarer Ebene ermöglicht. Der vorliegende Antrag verfolgt einen neuartigen Ansatz zur Untersuchung der strukturellen und dynamischen Veränderungen eines repräsentativen RBP (CPEB1), das am RNA-Silencing beteiligt ist und in Stressgranula (SGs), einem zytoplasmatischen Kondensat, vorkommt. Mit Hilfe neu entwickelter NMR-Methoden, die auf Methylgruppen und paramagnetischen Sonden basieren, werde ich die lokale (atomare Ebene) und globale (Domänenebene) Rekonfiguration von CPEB1 in rekonstituierten Kondensaten unter in vitro Bedingungen untersuchen. Mit diesem Ansatz möchte ich neue Einblicke in die möglichen Auswirkungen von Konformationsänderungen von RBPs in Kondensaten auf ihre RNA-Erkennungsfunktionen gewinnen.

• DFG-Verfahren: WBP Stipendium
• Internationaler Bezug: Kanada
• Gastgeber: Professor Lewis Kay, Ph.D.