Proteomische und Einzelzell-transkriptomische Landschaft der zellulären Plastizität bei myeloischen Malignomen (Z03)

• Fachliche Zuordnung: Hämatologie, Onkologie
• Förderung: Förderung seit 2025
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 533056198

Transkriptomische, epigenomische und proteomische Profilerstellung sind Schlüsseltechnologien im SFB, um die Zellplastizität zu untersuchen und zu verstehen. Das Projekt Z03 wird eine technologische Plattform für eine konsistente und hochmoderne Proteom-, Einzelzell-Transkriptom- und Chromatin-Zugänglichkeitsanalyse von Zellproben bereitstellen, die aus Zellliniensystemen, Tiermodellen und Patientenproben unter verschiedenen Behandlungsarten gewonnen wurden. Die Integration von Multi-omics-Daten aus den SFB-Projekten wird einen übergreifenden Blick auf gemeinsame und geteilte regulatorische Programme ermöglichen, die der Zellplastizität zugrunde liegen und die Erstellung einer Plastizitätslandschaft für myeloische Malignome ermöglichen. Um dies zu erreichen, wird dieses Projekt eng mit den einzelnen Forschungsprojekten im SFB zusammenarbeiten, indem es SOPs für die Sammlung und Verarbeitung von Zellproben bereitstellt, massenspektrometrie-basierte Analysen durchführt, proteomische und transkriptomische Daten analysiert und die Daten mehrerer Projekte zu CITE-Seq, Proteomik und scATAC-Seq integriert.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1709: Zelluläre Plastizität bei Myeloischen Erkrankungen: Von Mechanismen zu zielgerichteten Therapien
• Antragstellende Institution: Ruprecht-Karls-Universität Heidelberg
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professor Dr. Jeroen Krijgsveld; Judith Zaugg, Ph.D.