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Projekt
Die Typ-VI-Sekretionssysteme von Bacteroides und dessen spezifischen Mechanismen für den Transmembrantransport von Effektorproteinen mit unbekannter Funktion
Fachliche Zuordnung
Stoffwechselphysiologie, Biochemie und Genetik der Mikroorganismen
Förderung
Förderung seit 2025
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 564279481
Die Bakterien der intestinalen Mikrobiota benötigen zelluläre Strukturen für die Interaktion mit ihrer abiotischen und biotischen Umwelt. Eine Maschinerie dafür ist das Typ-VI-Sekretionssystem (T6SS), ein hochentwickelter molekularer Komplex für den Transport von Proteinen durch die innere und äußere Membran eines Bakteriums. Es ist bekannt, dass sekretierte ‘T6SS-Effektorproteine‘ konkurrierende Bakterien- und Pilzzellen abtöten, Wirtszellen manipulieren und bei der Nährstoffbeschaffung helfen. Obwohl solche Sekretionssysteme in Bakterien der menschlichen Darmmikrobiota identifiziert wurden, sind Struktur und Funktion mehrerer Proteine, die in T6SS-Genen von Nicht-Modellorganismen kodiert werden, unbekannt. Wir konzentrieren uns auf die T6SSs von Bacteroides-Isolaten, die von SPP-Mitgliedern, insbesondere von Thomas Clavel, Ruth Schmitz-Streit und Nassos Typas, gesammelt wurden. Wir kombinieren die komplementäre Expertise der Arbeitsgruppe Unterweger in der T6SS-Genomik und der Arbeitsgruppe Sondermann in der Entschlüsselung der Struktur und Funktion von Proteinen, um ein besseres molekulares und mechanistisches Verständnis der Mikrobiota-spezifischen T6SS zu erlangen. Unsere Ziele sind i) die phänotypische und genotypische Charakterisierung der Bacteroides T6SSs und ii) die Entschlüsselung der Struktur und Funktion verschiedener Apparatusproteine und neuer Effektorproteine. Die vorgeschlagenen Experimente werden unser Verständnis der zellulären Strukturen und Funktionen von Mikroorganismen des menschlichen Darms, die keine Modellorganismen sind, verbessern. Dieses Projekt wird die gemeinsamen Ressourcen und Werkzeuge innerhalb dieses SPP nutzen, von Bakterienisolaten (Z-Projekt) bis hin zu Werkzeugen für genetische Manipulation und Proteomik. Wir werden zu dem SPP auf verschiedene Weise beitragen, unter anderem mit unserer Expertise in der molekularen Mikrobiologie und bei der Entschlüsselung von Genen mit unbekannter Funktion, und durch unsere aktive Teilnahme an SPP Aktivitäten.
DFG-Verfahren
Schwerpunktprogramme
