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Projekt
Genetische Einflussfaktoren auf die räumliche Ökologie im Umfeld von Nahrungssubstraten
Antragsteller
Dr. Martin Thomas Jahn
Fachliche Zuordnung
Mikrobielle Ökologie und Angewandte Mikrobiologie
Förderung
Förderung seit 2025
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 564415106
Die Darmmikrobiota spielt eine entscheidende Rolle für die menschliche Gesundheit, indem sie Ballaststoffe in nützliche Stoffwechselprodukte wie kurzkettige Fettsäuren (SCFAs) umwandelt. Die Wechselwirkungen zwischen Darmmikroben und Ballaststoffen sind jedoch komplex und schlecht verstanden, was die Entwicklung gezielter mikrobiombasierter Therapien behindert. Dieses Projekt soll diese Lücke schließen, indem die genetische, räumliche und zeitliche Organisation des Faserabbaus im Darm untersucht wird. Zu diesem Zweck werden wir fortschrittliche bildgebende Verfahren einsetzen, um die funktionelle Organisation der Darmmikrobiota in Bezug auf bestimmte Faserpartikel zu kartieren, und in vivo- und in vitro-Experimente durchführen, um kausale Beziehungen zwischen Genen und Faserabbau herzustellen. Unsere Forschung ist in drei miteinander verbundene, aber unabhängige Arbeitspakete gegliedert: (1) Charakterisierung der räumlichen Genomik des Ballaststoffabbaus in vivo (2) Untersuchung der räumlich-zeitlichen Dynamik des Faserabbaus durch Verfolgung der Bakterienpopulationen beim Übergang vom planktonischen zum fasergebundenen Zustand und Analyse der genetischen und regulatorischen Mechanismen, die diese Prozesse steuern; und (3) Untersuchung der räumlichen Ökologie des Faserabbaus durch Untersuchung, wie Interaktionen zwischen Arten, wie Syntrophie und Competition, die räumliche Organisation und Effizienz des Faserabbaus beeinflussen. Letztendlich wird dies die Grundlage für eine gezielte Beeinflussung der mikrobiellen Gemeinschaften im Darm bilden, um die Gesundheitsergebnisse zu verbessern. Unser Programm hat ein enormes Interaktionspotential mit SPP 2474 Gruppen (siehe Projektintegration in das SPP 2474) und fügt sich nahtlos in die Kernziele des SPP 2474 ein, indem es sich auf das Verständnis der unerforschten Funktionen von Genen in wichtigen menschlichen Darmbakterien konzentriert und über beschreibende Assoziationen hinausgeht, um kausale Mechanismen zu entschlüsseln.
DFG-Verfahren
Schwerpunktprogramme
