Räumliche und funktionelle Analyse intratumoraler Mikrobiota und deren Einfluss auf das Therapieansprechen beim kolorektalen Karzinom

• Antragstellerin: Professorin Dr. Elke Burgermeister
• Fachliche Zuordnung: Gastroenterologie
• Förderung: Förderung seit 2025
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 537604907

Die Bedeutung des intratumoralen Mikrobioms des kolorektalen Karzinoms steht im Fokus vielfältiger Untersuchungen. Der räumliche Kontext der intratumoralen Mikrobiota im Tumor und die genauen molekularen Mechanismen der Wechselwirkung zwischen intratumoralen Bakterien und Tumorzellen sind jedoch nach wie vor kaum bekannt. Dieses Projekt untersucht den Einfluss intratumoraler Mikroben auf die onkogene Signalübertragung im Darmkrebs, daraus entstehende funktionelle Adaptationen des Tumors und Folgen für das Therapieansprechen beim kolorektalen Karzinom. Damit soll dieses Projekt Erkenntnisse zur Krebsbiologie und Ansätze für eine personalisierte Therapie liefern. G. Zeller, früher am EMBL tätig, jetzt an der Universität Leiden beheimatet, hat dazu hochmoderne Ansätze zur Kartierung der zellulären Identität und Aktivität von Wirtszellen und Mikroben in situ entwickelt, die Mikrobiom-Bildgebung und Tumortranskriptom-Sequenzierung kombinieren. G. Zellers einzigartige Expertise in der (räumlichen) Tumor-Mikrobiomanalyse wird dabei durch E. Burgermeisters komplementären Schwerpunkt und Hintergrund in der funktionellen Untersuchung von Bakterien-Tumor-Interaktionen unter Verwendung translationaler Krebsmodelle ergänzt. Gemeinsam werden beide Gruppen die in situ identifizierten Komponenten im Darmkrebs anhand von Organoidmodellen aus primären Tumoren und Metastasen des Darmkrebses rekonstruieren. Das Ziel des Projektes ist die Aufklärung mechanistischer und räumlicher Abläufe der Mikroben-Wirt-Interaktion im Tumor. Diese Daten sollen auch im Hinblick auf ihre Auswirkungen auf die Wirksamkeit von Chemo- und zielgerichteten Therapien analysiert werden und damit den Weg für zukünftige Mikrobiom-orientierte Therapieansätze zur Überwindung der Therapieresistenz bei metastasierter Tumorerkrankung ebnen.

• DFG-Verfahren: Forschungsgruppen
• Teilprojekt zu: FOR 5806: Funktionelle Genomik und Mikrobiomik in der Präzisionsmedizin des kolorektalen Karzinoms
• Kooperationspartner: Professor Dr. Georg Zeller