Mechanische Züchtung von DNA/RNA-Sequenzen (A04)

• Fachliche Zuordnung: Statistische Physik, Nichtlineare Dynamik, Komplexe Systeme, Weiche und fluide Materie, Biologische Physik
• Förderung: Förderung seit 2012
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 201269156

In der Biologie wählt die Evolution Sequenzen basierend auf ihrer Funktion aus. Wir werden diese Logik rein mechanisch in einem mikrofluidischen Parkour implementieren. Die kürzlich gefundene Sedimentation von Oligonukleotiden hat gezeigt, dass selbst 36mer kurze Sequenzen innerhalb weniger Minuten durch Bildung millimetergroßer hydrogelartiger Phasen spontan sedimentieren. Ausgehend von zufälligen Sequenzpools werden wir mechanische Auswahlstrategien in einer Reihe von mikroskopischen Nonequilibria mittels Illumina-Sequenzierung untersuchen. Wir werden uns auf die Selektion einer Ligasefunktion und der Bindung von Sequenzen an kurze Peptide konzentrieren.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1032: Nanoagenzien zur raumzeitlichen Kontrolle molekularer und zellulärer Reaktionen
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Dieter Braun