Simulationen und Multiskalenmodellierung von multivalenten Zucker-Protein-Wechselwirkungen (C09)

• Subject Area: Theoretical Chemistry: Electronic Structure, Dynamics, Simulation
• Term: from 2012 to 2019
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 32049920

Für die Modellierung multivalenter Wechselwirkungen nutzen wir eine Kombination aus Moleküldynamik-Simulationen, coarse-grained Simulationen und analytischen Multiskalenmodellen. Mit den in der letzten Förderperiode entwickelten Methoden sollen multivalente Sialinsäure-basierte Liganden zur Bindung an Influenza-Hämagglutinin optimiert werden. Mit unserem optimierten atomistischen Polyglycerol (PG) Kraftfeld soll das elastische und osmotische Quellverhalten von hyperverzweigtem PG quantifiziert und die Wechselwirkung zwischen PG-Nanopartikeln und Viren bestimmt werden. Außerdem sollen die Wechselwirkungen zwischen verschiedensten funktionalisierten planaren Oberflächen in Anwesenheit von Wasser berechnet werden um so die an eine gegebene pathogene Oberfläche optimal bindende synthetische Oberfläche vorherzusagen.

• DFG Programme: Collaborative Research Centres
• Subproject of: SFB 765: Multivalency as Chemical Organisation and Action Principle: New Architectures, Functions and Applications
• Applicant Institution: Freie Universität Berlin
• Project Head: Professor Dr. Roland Netz