Die Kopplung von Protein-, Wasser- und Protonierungsdynamik in Kanalrhodopsinen und Photosystem-II (C04)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2013 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 221545957

Für die jeweilige Proteinfunktion entscheidend sind in Kanalrhodopsin (ChR) und Photosystem-II (PSII) Veränderungen der Protonierungszustände von Aminosäureresten, die mit der Dynamik der Proteinkonformation und der proteininternen Wassermoleküle zusammenwirken. Es werden Methoden der theoretischen Biophysik eingesetzt, um die Dynamik von ChR und PSII in der Umgebung der hydratisierten Lipidmembranen zu untersuchen, die Antwort der Protein- und Wasserdynamiken auf Protonierung oder Mutationen zu ermitteln, das Netzwerk aus Wasserstoffbrückenbindungen zu analysieren und Protonentransferpfade zu berechnen.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1078: Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik
• Antragstellende Institution: Freie Universität Berlin
• Teilprojektleiterin: Professorin Dr. Ana Nicoleta Bondar, Ph.D.