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Professor Dr. Mario Stanke

Adresse Universität Greifswald
Institut für Mathematik und Informatik
Lehrstuhl für Bioinformatik
Walther-Rathenau-Straße 47
17489 Greifswald

Projekte

Als Antragsteller
- laufende Projekte
  - Aufdecken der genomischen Innovationen bei der Entstehung von Holometabolie (Schwerpunktprogramme)
  - Deep Learning von Proteinfamilien und Multiplen Sequenzalignment (Sachbeihilfen)
  - Ein reguläre Grammatiken berücksichtigendes tiefes Seq2seq-Grundlagenmodell für Genome und Genomannotation (Sachbeihilfen)
- abgeschlossene Projekte
  - Verbesserung des eukaryotischen Genvorhersageprogramms AUGUSTUS (Forschungsstipendien)
  - Automatic Localization of Complete Protein Coding Genes in Eukaryotic Genomes (Sachbeihilfen)
  - Classification of HIV-1 Using Coalescent Theory (Sachbeihilfen)
  - Structural genome annotation and quantification of transcripts based on ultra-high-throughput transcriptome sequencing (Sachbeihilfen)
  - A comparative approarch to genome annotation in Tribolium (Forschungsgruppen)
  - GAIUS - Wartungsarbeiten für die Nachhaltigkeit von AUGUSTUS (Forschungsdaten und Software)
Als beteiligter Wissenschaftler
- abgeschlossene Projekte
  - GRK 1870: Bakterielle Atemwegsinfektionen - Allgemeine und spezifische Mechanismen der Adaption von Pathogenen und der Immunabwehr (Graduiertenkollegs)
Als Beteiligte Person
- abgeschlossene Projekte
  - Verbesserung der Vorhersage neuer Mitglieder von Proteinfamilien in eukaryotischen Genomen am Beispiel der Analyse der Kinesin-Motorproteine (Sachbeihilfen)
Als Mitverantwortlich
- laufende Projekte
  - Gen- und Genomduplikation und phänotypische Neuerungen – Erkenntnisse aus Spinnen und Insekten (Schwerpunktprogramme)

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