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Teilnahme an einem Sommerkurs "Computational phyloinformatics", am National Evolutionary Synthesis Center, Durham, USA 24. Juli bis 04. August 2008
Antragsteller
Professor Dr. Bánk Beszteri
Fachliche Zuordnung
Bioinformatik und Theoretische Biologie
Förderung
Förderung in 2008
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 100328670
Ein wesentlicher Teil meiner aktuellen Forschungs- und Entwicklungsarbeit liegt auf dem Gebiet der Molekularphylogenie / „Phylogenomik oder auch (mit diesem neuen Wort) Phyloinformatik. Ich verstehe unter diesen Begriffen interdisziplinäre Arbeiten, die zum einen die bioinformatorische Entwicklung von phylogenetischen Analysesystemen, programmatischen Workflows, Pipelines, und zum anderen deren Einsatz zur Beantwortung von evolutionsbiologischen, genomischen oder anderen Fragestellungen beinhalten. Meine Haupttätigkeiten in diesem Bereich sind die Koordination der Entwicklung eines High-Throughput phylogenetischen Analysesystems für die funktionelle und taxonomische Annotierung von unbekannten Sequenzen (PhyioGena), und die Verwendung von molekularphylogenetischen Methoden für die Rekonstruktion der Genomevolution von komplexen Algen (s. im Detail im Anhang). Letzteres umfasst auch die Programmierung kleinerer, maßgeschneiderten Analyseskripte.
DFG-Verfahren
Sachbeihilfen