Evolutionäre und funktionelle Analyse von cis-regulatorischen Sequenzen (A11)

• Fachliche Zuordnung: Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2009 bis 2015
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5486242

Unser Fernziel ist die Rekonstruktion des Genregulationsnetzwerkes der Hefe durch genomweiteAnalyse der Transkriptionsfaktorbindestellen und Integration mit Genexpressionsdaten.Wir werden quantitative statistische Modelle der Transkriptionsregulation durch den Mediatorentwickeln und das Problem der Parameterschätzung mit neuartigen Bayes’schen Sampling-Methoden angehen, die es erlauben, Kombinationen von Millionen stark korrelierter Parametereffektiv abzusuchen. Wir möchten die Netzwerkanalyse mit der Promotoranalyse kombinieren,indem wir die transkriptionelle Antwort der cis-regulatorischen Module modellieren.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 646: Regulatorische Netzwerke in Expression und Erhalt des Genoms
• Antragstellende Institution: Ludwig-Maximilians-Universität München
• Teilprojektleiter: Dr. Johannes Söding, bis 12/2015