Entwicklung und Erprobung von Methoden zur Meta-Analyse phylogenetischer Studien bei Nutztieren

• Applicant: Dr. Helge Täubert
• Subject Area: Veterinary Medical Science
• Term: from 2005 to 2008
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 14844133

Phylogenetische Studien werden zur Darstellung genetischer Distanzen zwischen Rassen bei ver-schiedenen Nutztierarten betrieben. Die zunehmenden Bemühungen übergeordneter Organisationen zur Entwicklung einheitlicher Markersets bei genetischen Differenzierungen ermöglichen durch eine zunehmende Überlappung der eingesetzten Methoden eine Vergleichbarkeit von unterschiedlichen Studien. Ziel dieses Forschungsvorhabens ist die Entwicklung von statistischen Methoden zur Meta-Analyse phylogenetischer Studien. Im Gegensatz zu bestehenden Ansätzen sollen hier die Informati-onen aufgrund der molekulargenetischen Ergebnisse kombiniert werden, um Rassen von verschiede-nen Studien miteinander ins Verhältnis zu setzen. Ein Algorithmus soll entwickelt werden, um zwei oder mehrere Studien mit Markeranalysen zu kombinieren. Ein Ansatz zur Lösung ist die Expectation-Maximization (EM)-Methode, fehlende Informationen aus mangelnden Überlappungen zu ergänzen. Es soll zur Entwicklung und Überprüfung des Verfahrens ein Simulationsprogramm entwickelt werden. Neben den theoretischen Ansätzen stehen aber auch verschiedene Datensätze von Rinderpopulatio-nen zur Verfügung, um die erarbeiteten Methoden zu testen. Das Vorhaben soll hauptsächlich am Trinity College, Dublin, Irland durchgeführt werden. Forschungsaufenthalte am International Livestock Research Institute in Kenia sollen afrikanische und europäische Studien miteinander verbinden.

• DFG Programme: Research Fellowships
• International Connection: Ireland, Kenya
• Hosts: Dr. Dan Bradley; Dr. Olivier Hanotte; Professor Dr. Henner Simianer