Funktionen der chloroplastidären Ribonukleoproteine in der Reifung und Stabilisierung plastidärer mRNAs und in der pflanzlichen Immunität
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Die chloroplastidären Ribonukleoproteine tragen auf bislang unbekannter Weise zur Stabilisierung und Edierung chloroplastidärer Transkripte bei und scheinen eine Rolle in der pflanzlichen Immunität zu spielen. Beiden Befunden wurde im Rahmen dieses Projektes nachgegangen. Um den Zusammenhang zwischen RNA Edierung und RNA Stabilität besser zu verstehen wurde die ndhF mRNA im Wildtyp und in cp31a Mutanten untersucht. Während diese mRNA als monocistronische und vollständig edierte (eine Edierungsstelle, 100% T auf cDNA Ebene) mRNA im Wildtyp akkumuliert, ist diese in cp31a Mutanten im Northern Blot nicht mehr nachweisbar und nur zu ca. 50% ediert (50% C und 50% T auf cDNA Ebene). Im Rahmen dieses Projektes konnte gezeigt werden, dass das cpRNP CP31A für die Ausprägung des stabilen 3‘-Endes der chloroplastidären ndhF mRNA verantwortlich ist. Ferner sind die in cp31a Mutanten beobachtenden Edierungsdefekte höchstwahrscheinlich auf den Stabilitätsdefekt der mRNA zurückzuführen, da kurze RNA Fragmente (<500 Nukleotide) der ndhF mRNA vollständig prozessiert (100% T auf cDNA Ebene) vorliegen. Weiterhin wurden zwei bislang unbekannte, abundante RNA Spezies mit demselben 3‘-UTR entdeckt. Diese sind antisense bezüglich dem essentiellen ycf1 Gen. Hinsichtlich einer potentiellen Rolle der cpRNPs für die pflanzliche Immunität konnte keine Evidenz gefunden werden, dass die cpRNPs CP31A, CP31B und CP29A einen Einfluss auf den Infektionsverlauf haben. Allerdings konnte gezeigt werden, dass der Level der ndhF mRNA offensichtlich eine Rolle für die Stärke der Hypersensitiven Response von Nicotiana tabacum spielt.
