Porinbasierte Hybridionenkanäle
Final Report Abstract
Die Arbeiten addressierten erfolgreich mehrere Engpässe beim Ion Channel Engineering von unspezifischen Porinen. Zum einen konnte das monomere Modellporin OmpG bzgl. seiner endogenen Leiteigenschaften soweit verbessert werden, dass unerwünschtes Flickering fast vollständig vermieden werden kann, was seine Verwendung als stochastischen Sensor sonst erheblich einschränkte. Durch die Weiterentwicklung zu einem Minimalporin gelang es zudem ein stark vereinfachtes und um ¼ verkleinertes Templat für weitergehende Studien zu schaffen. Die Einführung von synthetischen Modulatoren für eine Verstrebung des Ionenleitwegs durch Verwendung bifunktionaler Verbindungen wurde systematisch untersucht. Allerdings zeigte sich, dass die Kopplungschemie entscheidenden Einfluss auf die Ausbeute entsprechend verstrebter Hybridporine nimmt und die eingeschlagene Synthesestrategie über Iodacetamid-aktivierte Modulatoren nicht aussichtsreich genug ist. Der Alternativweg über mit je zwei synthetischen Modulatoren modifizierter OmpG-Varianten verlief dagegen erfolgreich, konnte aber im gegebenen Zeitraum nicht bis zur Entwicklung einer schaltbaren Pore getrieben werden. Insgesamt zeigte sich besonders bei diesem Projektteil, dass die rasche Synthese neu spezifizierter Modulatoren mit den gegebenen Ressourcen unzureichend war und mit den Arbeiten auf proteinchemischer Ebene deshalb nur schwer Schritt halten konnte. Für das mitochondriale Porin VDAC1 konnten wir zeigen, dass sein α-helikaler N- terminus bestimmend für dessen Leiteigenschaften ist und das Gating-Verhalten durch Interaktion mit dem pro-apoptotischen Faktor tBid moduliert werden kann.
Publications
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Chemical engineering of Mycobacterium tuberculosis dodecin hybrids. Chem. Commun., 47,11071-11073
Vinzenz, X., Grosse, W., Linne, U., Meissner, B., Essen, L.‐O.
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Strategies and perspectives in ion-channel engineering. ChemBioChem, 12, 830-839
Grosse, W., Essen, L.-O., Koert, U.
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Flexibility of the N-terminal mVDAC1 segment controls the channel`s gating behavior. PLoS One, 7, e47983
Mertins, Barbara; Psakis, Georgios; Grosse, Wolfgang; Back, Katrin Christiane; Salisowski, Anastasia; Reiss, Philipp; Koert, Ulrich & Essen, Lars-Oliver
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Ion-Channels: Goals for Function-oriented Synthesis Acc. Chem. Res., 46, 2773-2780
Reiß, Philipp & Koert, Ulrich
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Structure-based engineering of a minimal porin reveals loop-independent channel closure. Biochemistry, 53 , 4826-4836
Grosse, Wolfgang; Psakis, Georgios; Mertins, Barbara; Reiss, Philipp; Windisch, Dirk; Brademann, Felix; Bürck, Jochen; Ulrich, Anne; Koert, Ulrich & Essen, Lars-Oliver
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VDAC: The wizard of mitochondrial OM, Biol. Chem., 395, 1435-1442
Mertins, Barbara; Psakis, Georgios & Essen, Lars-Oliver
