Verteilung, metabolische Fähigkeiten und Phagen-Wirts Wechselwirkungen der Roseobacter-Gruppe in marinen Sedimenten (A02)

• Fachliche Zuordnung: Mikrobielle Ökologie und Angewandte Mikrobiologie
• Förderung: Förderung von 2010 bis 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 34509606

Dieses Projekt wird bisher unbekannte benthische Roseobacter-Vertreter von verschiedenen metagenomischen Datensätzen studieren und sie als neue benthische Cluster definieren. Des Weiteren werden Isolate der Forschungsfahrten in den Pazifik 2017 genomsequenziert, um spezifische Eigenschaften für deren Leben in benthischen Habitaten zu identifizieren. Ein weiterer Aspekt behandelt die Rolle von Phagen für benthische Roseobacter. Phageninduktionsversuche werden durchgeführt, um charakteristische Parameter der Phagen-Wirtsbeziehungen zu bestimmen. Außerdem werden die Metagenome der Pazifiksedimente auf Roseophagen-spezifische Signaturen hin durchsucht und deren Verteilung in den Sedimentproben mittels qPCR mit Phagen-spezifischer Primer quantifiziert.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 51: Ökologie, Physiologie und Molekularbiologie der Roseobacter-Gruppe: Aufbruch zu einem systembiologischen Verständnis einer global wichtigen Gruppe mariner Bakterien
• Antragstellende Institution: Carl von Ossietzky Universität Oldenburg
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Heribert Cypionka, bis 12/2017; Privatdozent Dr. Bert Engelen