Phylogenomik und funktionelle Genomik der Roseobacter-Gruppe (A06)

• Fachliche Zuordnung: Stoffwechselphysiologie, Biochemie und Genetik der Mikroorganismen
• Förderung: Förderung von 2010 bis 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 34509606

Dieses Projekt wird die phylogenomischen und funktionellen genomischen Untersuchungen der Roseobacter-Gruppe fortsetzen. Die inzwischen beträchtlich erweiterten phylogenomischen Bäume sollen genutzt werden, um tiefere Einblicke in die Evolution der genomischen Eigenschaften und ihrer ökologischen Bedeutung zu erhalten. Die Bäume werden spezifischer annotiert mit gezielter Analyse der kohlenhydratabbauenden Enzyme, Sulfatasen, Peptidasen, Transporter und Prophagen. Des Weiteren sollen etablierte Methoden für die Annotation der Phagenphylogenie und –klassifizierung verbessert werden durch eine schnellere Suche nach Sequenzähnlichkeiten.

• DFG-Verfahren: Transregios
• Teilprojekt zu: TRR 51: Ökologie, Physiologie und Molekularbiologie der Roseobacter-Gruppe: Aufbruch zu einem systembiologischen Verständnis einer global wichtigen Gruppe mariner Bakterien
• Antragstellende Institution: Carl von Ossietzky Universität Oldenburg
• Teilprojektleiter: Privatdozent Dr. Markus Göker; Privatdozent Dr. Hans-Peter Klenk, bis 12/2017