Funktionelle Charakterisierung von Proteinen der Zuckerrübe die mit dem Pathogenitätsfaktor P25 des beet necrotic yellow vein virus interagieren

• Antragstellerin: Dr. Heike Thiel
• Fachliche Zuordnung: Pflanzenzüchtung, Pflanzenpathologie
• Förderung: Förderung von 2010 bis 2013
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 165716485

Das von der RNA3 des BNYVV kodierte Genprodukt P25 ist für die Translokation des Virus im Wurzelsystem und die Symptomausprägung in anfälligen Zuckerrübengenotypen verantwortlich. Die der Wirt-Pathogen Interaktion zugrunde liegenden Funktionen des Pathogenitätsfaktors P25 sind bisher ungeklärt. Im Rahmen einer Durchmusterung einer Zuckerrüben cDNA Expressionsbibliothek mit P25 wurden eine Vielzahl von Interaktionspartnern identifiziert. Daher soll eine vollständige Isolation, funktionelle Charakterisierung und Bestimmung der subzellulären Lokalisation von 15 cDNA Kandidaten, die mit P25 physikalisch in Hefe interagieren, vorgenommen werden. Einigen der Kandidaten werden unter anderem aufgrund von Datenbankanalysen als Beteiligte am Phytohormonmetabolismus, Zellzyklus, an pflanzlicher Resistenz und dem Ubiquitin-Proteasom mögliche Funktionen in der Virus- Pathogenität bzw. im pflanzlichen Resistenzmechanismus zugeschrieben. Für eine Charakterisierung müssen die Sequenzen der zu untersuchenden Kandidaten als Voll-Längen- Sequenzen vervollständigt und auf Nukleotid- und Aminosäureebene analysiert und Proteindomänen und dessen Funktionen nachgewiesen werden. Ein bereits vollständig vorliegender Kandidat mit möglicher Resistenzbeteiligung, das F-box Protein, soll für ein erneutes Screening der cDNA Bibliothek eingesetzt werden, um auf diesem Weg Target Proteine, zu identifizieren. Die geplanten Experimente umfassen Analysen von Voll-Längen-Sequenzen, Nachweis von Protein-Protein Interaktionen in planta und in vitro und die Bestimmung von cytologischer Lokalisation. Mit den Ergebnissen sollen die bisher gefundenen putativen Interaktionen abgesichert und Zusammenhänge zwischen pathogener Funktion des P25 und dem antiviralen Resistenzmechanismus der Zuckerrübe abgeleitet werden.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen