Konformationsanalyse neuer potentieller Chitinaseinhibitoren mit NMR-Spektroskopie und Molecular Modelling-Methoden im freien und enzym-gebundenen Zustand
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Wir beabsichtigten, die Struktur und Konformation einer Reihe neu synthetisierter Chitinaseinhibitoren mit Parametern der NMR-Spektroskopie (δ, J, NOE) und Methoden des Molecular Modelling zu untersuchen. Da es sich hierbei um Kohlenhydratderivate hoher intramolekularer Flexibilität handelt, steht die Aufklärung der zugehörigen Konformationsgleichgewichte im Mittelpunkt. Die Synthesen dieser neuen Inhibitoren im Arbeitskreis von Prof. Martin G. Peter, Universität Potsdam zielen neben einer hohen Wirksamkeit auf die Chitinasen A und B sowie N-Acetylglucosamlnidase auf eine höhere Hydrolysestabilitat der Verbindungen. Weiterhin beabsichtigen wir, die Bindung der Kohlenhydratderivaten an die erwähnten Chitinasen, ihre Konformation in enzym-gebundenen Zustand, das Bindungsepitop und ihre genaue Lage in der Bindungstasche der Enzyme zu untersuchen. Informationen hierüber sollen mit speziellen Methoden der NMR-Spektroskopie (STD, trNOE, DOSY) erhalten und mit Ergebnissen des begleitenden Molecular Modelling (Kraftfelder, ab intio MO und DFT Berechnungen) zusammengeführt werden.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- Tetrahedron 65, 4356-4366 (2009). Synthesis and conformational analysis of glycomimetic analogs of thiochitobiose
A. Fettke, D. Peikow, M. G. Peter, E. Kleinpeter
- J. Magn. Reson. 202, 245-249 (2010). STD-DOSY: A new NMR method to analyze multi-component enzyme/substrate systems.
M. Kramer, E. Kleinpeter
- Tetrahedron 66, 4079-4088 (2010). Lectin-bound conformations and non-covalent interactions of glycomimetic analogs of thiochitobiose
A. Fettke, M. Kramer, E. Kleinpeter
