Project Details
Projekt
Computer-assisted design and characterization of natural product mimetics
Applicant
Professor Dr. Gisbert Schneider
Subject Area
Pharmacy
Term
from 2010 to 2015
Project identifier
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 159663715
Besonders im Bereich der Krebsforschung stellen Naturstoffe und deren Derivate eine Hauptquelle für Innovation in der Entdeckung neuer Leitstrukturen dar. Computergestützte Strategien für das „in silico“ Screening spielen eine zentrale Rolle sowohl bei der Identifizierung der am besten geeigneten chemischen Grundgerüste und Kandidaten für die biologische Testung, als auch bei der Leitstrukturoptimierung. Wir werden dieses Konzept um den Blickwinkel der Chemischen Biologie auf die molekularen Wirkmechanismen erweitern. Dabei sollen insbesondere multiple Targetprofile berücksichtigt werden und letztlich ein Konzept für das multi-dimensionale Moleküldesign implementiert werden. Wir werden QM-Methoden einsetzen und neue computergestützte Techniken entwickeln, um die strukturellen Voraussetzungen für biologische Aktivität bei Naturstoffen im Allgemeinen und fokussiert auf myxobakterielle Naturstoffe im Besonderen zu untersuchen. Aus diesen theoretischen Studien wird ein „Lexikon der Naturstoff-Pharmakophore“ entstehen. Unter Einsatz von automatisierten Entwurfsmethoden sollen Naturstoffmimetika entstehen, welche dann als Substanzen mit gewünschtem Aktivitätsprofil chemisch synthetisiert werden. Wir beabsichtigen, exemplarisch Archazolidmimetika zu entwickeln und Wirkungsmodi dieser zytostatischen Substanz vorherzusagen. In ähnlicher Weise soll das Design von Prätubulysin-, Chondramid- und Soraphen-Mimetika erfolgen.
DFG Programme
Research Units
International Connection
Switzerland
