Raumzeitliche Simulation von Modulassemblierung und -funktion (D07)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung von 2011 bis 2018
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 25065445

Wir entwickeln effiziente rechnergestützte Methoden, um die Simulation von funktionalen Modulen zu ermöglichen. Diese Methoden beruhen auf einer Kombination von adaptiver Molekulardynamik und partikelbasierter Reaktions-Diffusions Dynamik. Wir wenden die Methoden an, um raumzeitliche Modul-Mechanismen aufzuklären, insbesondere die Phototransduktion in der Stäbchenzelle, die durch Lichtaktivierung von Rhodopsin getriggert wird; sowie die Abtrennung von endozytierten Vesikeln durch Oligomerisierung und Dynamik von Dynamin.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 740: Von Molekülen zu Modulen: Organisation und Dynamik zellulärer Funktionseinheiten
• Antragstellende Institution: Gemeinsam FU Berlin und HU Berlin durch:; Charité - Universitätsmedizin Berlin
• Mitantragstellende Institution: Freie Universität Berlin
• Teilprojektleiter: Professor Dr. Frank Noé