Hochleistungsflüssigkeitschromatographie-Anlage mit hochauflösendem Ionenfallen-Hybridmassenspektrometer
Final Report Abstract
Mithilfe des hochauflösendem Ionenfallen/Orbitrap Hybridmassenspektrometers konnten am Standort Düsseldorf verschiedene massenspektrometrische Methoden etabliert und erfolgreich angewendet werden. Hervorzuheben ist die Etablierung der markierungsfreie Massenspektrometrie mit deren Hilfe im Bereich der Sekretom- und Proteomanalyse umfangreich Studien durchgeführt und publiziert werden konnten. Basierend auf dieser Methode zur Quantifizierung von Proteinen konnte ebenfalls die Identifizierung von Protein- Interaktionspartnern erfolgreich etabliert werden. Auch wurde das angeschaffte hochauflösendem Hybridmassenspektrometers für die Analyse von posttranslationalen Modifikationen wie etwa Phosphorylierung, S-Glutathionylierung oder auch Acetylierung eingesetzt. Aufgrund der hohen Sensitivität und Massengenauigkeit des Geräts war es möglich Experimente mit geringsten Probenmengen hochzuverlässig und exakt durchzuführen.
Publications
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Glutaredoxin regulates vascular development by reversible glutathionylation of sirtuin 1. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Dec 10;110(50):20057-62
Bräutigam, Lars; Jensen, Lasse Dahl Ejby; Poschmann, Gereon; Nyström, Staffan; Bannenberg, Sarah; Dreij, Kristian; Lepka, Klaudia; Prozorovski, Timour; Montano, Sergio J.; Aktas, Orhan; Uhlén, Per; Stühler, Kai; Cao, Yihai; Holmgren, Arne & Berndt, Carsten
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Proteomic Profiling of Ex Vivo Expanded CD34- Positive Haematopoetic Cells Derived from Umbilical Cord Blood. Stem Cells Int. 2013;2013:245695
Falkenberg, Heiner; Radke, Teja Falk; Kögler, Gesine & Stühler, Kai
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The p90 ribosomal S6 kinase (RSK) inhibitor BI- D1870 prevents gamma irradiation-induced apoptosis and mediates senescence via RSK- and p53-independent accumulation of p21WAF1/CIP1. Cell Death Dis. 2013 Oct 17;4:e859
Neise, D.; Sohn, D.; Stefanski, A.; Goto, H.; Inagaki, M.; Wesselborg, S.; Budach, W.; Stühler, K. & Jänicke, R. U.
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Tra2-mediated recognition of HIV-1 5' splice site D3 as a key factor in the processing of vpr mRNA. J Virol. 2013 Mar;87(5):2721-34
Erkelenz, Steffen; Poschmann, Gereon; Theiss, Stephan; Stefanski, Anja; Hillebrand, Frank; Otte, Marianne; Stühler, Kai & Schaal, Heiner
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How stemlike are sphere cultures from long-term cancer cell lines? Lessons from mouse glioma models. J Neuropathol Exp Neurol. 2014 Nov;73(11):1062-77
Ahmad, Mushfika; Frei, Karl; Willscher, Edith; Stefanski, Anja; Kaulich, Kerstin; Roth, Patrick; Stühler, Kai; Reifenberger, Guido; Binder, Hans & Weller, Michael
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Identification of novel adipokines differential regulated in C57BL/Ks and C57BL/6. Arch Physiol Biochem. 2014 Dec;120(5):208-15
Hartwig, Sonja; Goeddeke, Simon; Poschmann, Gereon; Dicken, Hans-Dieter; Jacob, Sylvia; Nitzgen, Ulrike; Passlack, Waltraud; Stühler, Kai; Ouwens, D. Margriet; Al-Hasani, Hadi; Knebel, Birgit; Kotzka, Jorg & Lehr, Stefan
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Proteome-wide analysis reveals an ageassociated cellular phenotype of in situ aged human fibroblasts. Aging (Albany NY). 2014 Oct;6(10):856-78
Waldera-Lupa, Daniel M.; Kalfalah, Faiza; Florea, Ana-Maria; Sass, Steffen; Kruse, Fabian; Rieder, Vera; Tigges, Julia; Fritsche, Ellen; Krutmann, Jean; Busch, Hauke; Boerries, Melanie; Meyer, Helmut E.; Boege, Fritz; Theis, Fabian; Reifenberger, Guido & Stuhler, Kai
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Zebrafish heart development is regulated via glutaredoxin 2 dependent migration and survival of neural crest cells. Redox Biol. 2014 May 2;2:673-8
Berndt, Carsten; Poschmann, Gereon; Stühler, Kai; Holmgren, Arne & Bräutigam, Lars
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Characterization of regenerative phenotype of unrestricted somatic stem cells from human umbilical cord blood by functional secretome analysis. Mol Cell Proteomics. 2015 Jul 16
Schira, Jessica; Falkenberg, Heiner; Hendricks, Marion; Waldera-Lupa, Daniel M.; Kögler, Gesine; Meyer, Helmut E.; Müller, Hans Werner & Stühler, Kai
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Characterization of Skin Aging-Associated Secreted Proteins (SAASP) Produced by Dermal Fibroblasts Isolated from Intrinsically Aged Human Skin. J Invest Dermatol. 2015 Aug;135(8):1954-68
Waldera Lupa, Daniel M.; Kalfalah, Faiza; Safferling, Kai; Boukamp, Petra; Poschmann, Gereon; Volpi, Elena; Götz-Rösch, Christine; Bernerd, Francoise; Haag, Laura; Huebenthal, Ulrike; Fritsche, Ellen; Boege, Fritz; Grabe, Niels; Tigges, Julia; Stühler, Kai & Krutmann, Jean
