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Transmissions-Elektronenmikroskop für Tomographie und Kryo-TEM

Subject Area Basic Research in Biology and Medicine
Term Funded in 2011
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 193770645
 
Final Report Year 2017

Final Report Abstract

In den vergangenen Jahren wurde das Transmissions-Elektronenmikroskop für die Aufzeichnung elektronenmikroskopischer und elektronentomographischer Datensätze (TEM und STEM Modus) und für Kryo-Elektronenmikroskopie an Zellen und Einzelmolekülen eingesetzt. Die STEM-Tomographie steht mittlerweile routinemäßig zur Verfügung. Mit dieser Technologie ist es uns möglich, über den Antrag hinausgehend Präparate mit einer Schnittdicke von bis zu 1000 nm zu untersuchen. Die Auswertung der Daten erfolgt off-line, d.h. separat und zeitversetzt an dafür vorgesehenen Workstations mit Verwendung von Spezialsoftware entweder durch tomographische Rekonstruktion oder durch Einzelteilchen-Analyse, einschließlich 3D-Visualisierung. Folgende Projekte wurden bearbeitet: Konventionelle Transmissions-Elektronenmikroskopie (TEM) und TEM-Tomographie von Schlitzmembranen der Niere zur Analyse der Komplexität der Ultrastruktur der Schlitzmembran. - Korrelative Licht- und Elektronenmikroskopie zur subzellulären Lokalisation u.a. von Proteinen, die in die Biogenese der Zilienmembran involviert sind. - Elektronenmikroskopische Analyse der (fehlgeleiteten) Verteilung eines für Peroxisomen synthetisierten Proteins in Mitochondrien. - Elektronenmikroskopische Analyse zur Rolle der Endozytose bei der Ausbildung der Zilienmembran. - Elektronenmikroskopische und elektronentomographische Analyse der Nephrozyten in Drosophila melanogaster. - TEM- und STEM-Tomographie zur Untersuchung der räumlichen Verteilung von Zielproteinen in Nierengewebe, u.a. Ionenkanäle (Anoctamin), Albumin und Rezeptoren in Podozyten; Analyse der Verteilung von Ladungen in der glomerulären Basalmembran. - Räumliche Darstellung von hyperthermophilen Archaeen (Ignicoccus, Nanoarchaeum, Pyrococcus, Nitrosopumilus) mittels TEM-Tomographie von Semidünnschnitten und Serienschnitten. - Kryo-Elektronenmikroskopie zur Einzelteilchen-Analyse von Membran-Glykoprotein-Komplexen der Niere, von Vorstufen der Ribosomen-Biogenese (Hefe), von bakteriellen Membranproteinen (u.a. Solut-Transportern) sowie Ionenkanälen und Transkriptions-Regulatoren in Archaeen. Für diese Zwecke musste und wird das Gerät laufend eingestellt, justiert und für die anstehenden Messverfahren optimiert. Dies schloss in den vergangenen Jahren mit ein: Einrichten und Optimieren des TEM und der die Bilder aufzeichnenden CMOS-Kamera für verschiedene Anwendungen, u.a. TEM-Tomographie, Elektronenbeugung, und Kryo-Elektronenmikroskopie unter Niederdosis-Bedingungen. - Einrichten des Gerätes und des Steuer-Rechners für TEM-Tomographie: dies beinhaltet die Installation, das Testen und die kontinuierliche Weiterentwicklung von zwei Softwarepaketen für die Ansteuerung des Gerätes, vollautomatische Einstellung der Präparathöhe und -stelle, Fokussierung unter Niederdosis- Bedingungen und Aufzeichnung des Datensatzes. - Einrichten des Gerätes für Kryo-Elektronenmikroskopie einschließlich Testen von zwei Softwarepaketen für die vollautomatische Abrasterung des Präparates unter Niederdosis-Bedingungen, Einstellung geeigneter Abbildungsbedingungen für das Wiederfinden von Präparatstellen (Tracking), Fokussieren unter Low-dose-Bedingungen, und Erstellen von Aufnahmeserien. - Erstmaliges Einrichten und Umprogrammieren eines 200 kV Transmissions-Elektronenmikroskops für STEM-Tomographie mit paralleler Beleuchtung an bis zu 1 µm dicken Schnitten, einschließlich Einstellung spezieller Linsenströme, sowie der Mit-Entwicklung einer geeigneten Software am Steuer-Rechner, einschließlich Autofokus für STEM sowie automatischer, paralleler Aufzeichnung von Hellfeldund Dunkelfeld-STEM-Bildern.

Publications

  • (2013) Photochemically Active Fluorophore-DNA/RNA Conjugates for Cellular Imaging of Nucleic Acids by Readout in Electron Microscopy. ChemistryOpen 2: 136-140
    Holzhauser C, Kracher S, Rubner MM, Schmucker W, Wagenknecht HA, Witzgall R
    (See online at https://doi.org/10.1002/open.201300017)
  • (2014) Mistargeting of peroxisomal EHHADH and inherited renal Fanconi's syndrome. N Engl J Med 370: 129-138
    Klootwijk ED, Reichold M, Helip-Wooley A, Tolaymat A, Broeker C, Robinette SL, Reinders J, Peindl D, Renner K, Eberhart K, Assmann N, Oefner PJ, Dettmer K, Sterner C, Schroeder J, Zorger N, Witzgall R, Reinhold SW, Stanescu HC, Bockenhauer D, Jaureguiberry G, Courtneidge H, Hall AM, Wijeyesekera AD, Holmes E, Nicholson JK, O'Brien K, Bernardini I, Krasnewich DM, Arcos- Burgos M, Izumi Y, Nonoguchi H, Jia Y, Reddy JK, Ilyas M, Unwin RJ, Gahl WA, Warth R, Kleta R
    (See online at https://doi.org/10.1056/NEJMoa1307581)
  • (2014) The calcium-activated chloride channel Anoctamin 1 contributes to the regulation of renal function. Kidney Int. 85: 1369-1381
    Faria D, Rock JR, Romao AM, Schweda F, Bandulik S, Witzgall R, Schlatter E, Heitzmann D, Pavenstädt H, Herrmann E, Kunzelmann K, Schreiber R
    (See online at https://doi.org/10.1038/ki.2013.535)
  • (2015) Advanced electron microscopic techniques provide a deeper insight into the peculiar features of podocytes. Am J Physiol Renal Physiol 309: F1082-F1089
    Burghardt T, Hochapfel F, Salecker B, Meese C, Gröne HJ, Rachel R, Wanner G, Krahn MP, Witzgall R
    (See online at https://doi.org/10.1152/ajprenal.00338.2015)
  • (2015) Integration of Cistromic and Transcriptomic Analyses Identifies Nphs2, Mafb, and Magi2 as Wilms' Tumor 1 Target Genes in Podocyte Differentiation and Maintenance. J Am Soc Nephrol 26: 2118-2128
    Dong L, Pietsch S, Tan Z, Perner B, Sierig R, Kruspe D, Groth M, Witzgall R, Gröne HJ, Platzer M, Englert C
    (See online at https://doi.org/10.1681/ASN.2014080819)
  • (2016) Intravital imaging reveals Angiotensin II-induced transcytosis of albumin by podocytes. J Am Soc Nephrol 27: 731-744
    Schießl IM, Hammer A, Kattler V, Gess B, Theilig F, Witzgall R, Castrop H
    (See online at https://doi.org/10.1681/ASN.2014111125)
  • (2017) Molecular Insights into lipid-assisted Ca2+ regulation of the TRP channel Polycystin-2. Nat Struct Mol Biol 24: 123-130
    Wilkes M, Madej MG, Kreuter L, Rhinow D, Heinz V, de Sanctis S, Ruppel S, Richter S, Joos F, Grieben M, Pike S, Huiskonen JT, Carpenter EP, Kühlbrandt W, Witzgall R, Ziegler C
    (See online at https://doi.org/10.1038/nsmb.3357)
  • (2017) Natriuretic Peptide Receptor Guanylyl Cyclase-A in Podocytes is Renoprotective but Dispensable for Physiologic Renal Function. J Am Soc Nephrol 28: 260-277
    Staffel J, Valletta D, Federlein A, Ehm K, Volkmann R, Füchsl AM, Witzgall R, Kuhn M, Schweda F
    (See online at https://doi.org/10.1681/ASN.2015070731)
 
 

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