NanoHPLC-gekoppeltes hochauflösendes Massenspektrometer für die Proteinanalytik
Final Report Abstract
Das beschaffte nano-HPLC gekoppelte Massenspektrometer wird zentral in der am Fachbereich Chemie angesiedelten Core-Facility für Massenspektrometrie betrieben. Aktuell greifen auf dieses Gerät ca. 35 experimentell arbeitende Gruppen des Fachbereichs Chemie sowie aus dem Forschungsverbund SYNMIKRO und dem SFB 987 zu. Darüber hinaus steht es aber auch sonstigen interessierten Forschungsgruppen der Philipps-Universität Marburg offen und auch extern greifen einige Nutzer zu (z.B. von der Justus-Liebig Universität Gießen sowie Frau Prof. Annegret Wilde von der Universität Freiburg). Das Gerät steht damit einem großen Nutzerkreis offen und ist nahezu voll ausgelastet. Es wird ausschließlich für proteinanalytische Fragestellungen eingesetzt, angefangen bei Einzelmessungen wie der Identifizierung von SDS-Gelbanden bis hin zu komplexen Projekten wie quantitativen Proteomics-Ansätzen und der Identifizierung von posttranslationalen Modifikationen. Im dritten Betriebsjahr haben wir das System zusätzlich zur Etablierung der H/D-Austauschmassenspektrometrie an Proteinen und Protein-Komplexen sowie zur Durchführung einiger HDX-Projekte verwendet.
Publications
- Two-Photon-Induced Selective Decarboxylation of Aspartic Acids D85 and D212 in Bacteriorhodopsin. J Phys Chem Lett. 2012 Oct 18;3(20):2991-4
Imhof M, Rhinow D, Linne U, Hampp N
(See online at https://doi.org/10.1021/jz301292n) - Covalent inhibition of SUMO and ubiquitin-specific cysteine proteases by an in situ thiol-alkyne addition. Bioorg Med Chem. 2013 May 1;21(9):2511-7
Sommer S, Weikart ND, Linne U, Mootz HD
(See online at https://doi.org/10.1016/j.bmc.2013.02.039) - Structural characterization of the heterobactin siderophores from Rhodococcus erythropolis PR4 and elucidation of their biosynthetic machinery. J Nat Prod. 2013 Dec 27;76(12):2282-90
Bosello M, Zeyadi M, Kraas FI, Linne U, Xie X, Marahiel MA
(See online at https://doi.org/10.1021/np4006579) - Temperature: the "ignored" factor at the NanoBio interface. ACS Nano. 2013 Aug 27;7(8):6555-62
Mahmoudi M, Abdelmonem AM, Behzadi S, Clement JH, Dutz S, Ejtehadi MR, Hartmann R, Kantner K, Linne U, Maffre P, Metzler S, Moghadam MK, Pfeiffer C, Rezaei M, Ruiz-Lozano P, Serpooshan V, Shokrgozar MA, Nienhaus GU, Parak WJ
(See online at https://doi.org/10.1021/nn305337c) - , Functional reconstitution of mitochondrial Fe/S cluster synthesis on Isu1 reveals the involvement of ferredoxin. Nat Commun. 2014 Oct 31;5:5013
Webert H, Freibert SA, Gallo A, Heidenreich T, Linne U, Amlacher S, Hurt E, Mühlenhoff U, Banci L, Lill R
(See online at https://doi.org/10.1038/ncomms6013) - A synthetic adenylation-domain-based tRNA-aminoacylation catalyst. Angew Chem Int Ed Engl. 2015 Feb 16;54(8):2492-6
Giessen TW, Altegoer F, Nebel AJ, Steinbach RM, Bange G, Marahiel MA
(See online at https://doi.org/10.1002/anie.201410047) - Isolation of Extracellular Polymeric Substances from Biofilms of the Thermoacidophilic Archaeon Sulfolobus acidocaldarius. Front Bioeng Biotechnol. 2015 Aug 27;3:123
Jachlewski S, Jachlewski WD, Linne U, Bräsen C, Wingender J, Siebers B
(See online at https://doi.org/10.3389/fbioe.2015.00123) - MinD-like ATPase FlhG effects location and number of bacterial flagella during C-ring assembly. Proc Natl Acad Sci USA. 2015 Mar 10;112(10):3092-7
Schuhmacher JS, Rossmann F, Dempwolff F, Knauer C, Altegoer F, Steinchen W, Dörrich AK, Klingl A, Stephan M, Linne U, Thormann KM, Bange G
(See online at https://doi.org/10.1073/pnas.1419388112) - Molecular insights into frataxin-mediated iron supply for heme biosynthesis in Bacillus subtilis. PLoS One. 2015 Mar 31;10(3):e0122538
Mielcarek A, Blauenburg B, Miethke M, Marahiel MA
(See online at https://doi.org/10.1371/journal.pone.0122538) - NOX1 supports the metabolic remodeling of HepG2 cells. PLoS One. 2015 Mar 25;10(3):e0122002
Bertram K, Valcu CM, Weitnauer M, Linne U, Görlach A
(See online at https://doi.org/10.1371/journal.pone.0122002)
