Molekulare Grundlagen der kooperativen Wirkungsweise der Helikase- und der Topoisomerase-Domänen in reverser Gyrase während der positiven Superspiralisierung von DNA (B13)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung von 2011 bis 2021
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 104405829

Die DNA-Topoisomerase reverse Gyrase besteht aus einer Helikase- und einer Topoisomerase-Domäne, deren Kooperation die neuartige Funktion der positiven DNA-Superspiralisierung ermöglicht. In der tRNA-Acetylase TmcA arbeitet eine Helikase-Domäne eng mit einer Transacetylase-Domäne zusammen. Wir werden die Kooperativität der DNA-Erkennung durch reverse Gyrase mittels Quervernetzung und Massenspektrometrie sowie Röntenstrukturanalyse untersuchen, und konzertierte Konformationsänderungen im katalytischen Zyklus mit Einzelmolekül-FRET verfolgen. Weiterhin werden wir die Kooperativität in Ligandenbindung und Konformationsänderungen im katalytischen Zyklus von TmcA analysieren. Ziel ist es, die molekulare Basis der funktionellen Kooperation von Helikase-Domänen mit anderen enzymatischen Domänen zu entschlüsseln.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 858: Synergetische Effekte in der Chemie - Von der Additivität zur Kooperativität
• Antragstellende Institution: Universität Münster
• Teilprojektleiterin: Professorin Dr. Dagmar Klostermeier