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Storage-System für Daten aus Hochdurchsatzexperimenten
Fachliche Zuordnung
Grundlagen der Biologie und Medizin
Förderung
Förderung in 2011
Projektkennung
Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 212933541
Das Genom ist die Gesamtheit der Erbinformation eines Lebewesens, die in der DNA codiert ist. Steuerinformationen, sogenannte epigenetische Modifikationen, bestimmen, wie die Information des Genoms verarbeitet wird. Die epigenetische Landschaft ist durch das Zusammenspiel verschiedener Einflüsse wie DNA Methylierung, Histon Modifikation und nucleosomale Position charakterisiert. Mit dem hier beantragten Gerät wird die Grundlage zur zentralen Archivierung der biologischen Datensätze und aller Analyse geschaffen. Weiterhin soll den Kooperationspartnern ein Zugriff auf die Daten ermöglicht werden. Die direkte Anbindung der großen Datenmenge zu den Computern, die die Analy-setools ausführen, ist von großer Bedeutung. Ziel ist es, genomweite nucleosomale Positionenkarten mit den zugehörigen Korrelationen zu DNA Methylierung und Histon-Modifikationen zu erstellen. Diese Positionen sollen zusätzlich der Simulation von Nucleosomenketten dienen, wobei die Modellierung der räumlichen Struktur im Hinblick auf die Diagnose von Krankheiten und der Entwicklung neuer Me-dikamente zukunftsweisend ist.
DFG-Verfahren
Forschungsgroßgeräte
Gerätegruppe
7000 Datenverarbeitungsanlagen, zentrale Rechenanlagen
Antragstellende Institution
Hochschule Stralsund
Leiter
Professor Dr. Gero Wedemann