Erweitertes Evolutives Design der Peptid-Nukleinsäure-Erkennung durch ribosomale Integration nichtribosomaler Interkalations-Strukturen

• Applicant: Professor Dr. Daniel Summerer
• Subject Area: Biochemistry
• Term: from 2012 to 2017
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 214448845

• Final Report Year: 2017

Final Report Abstract

Das Projekt resultierte in der genetischen Kodierung mehrerer neuer UAA mit Potential für alternative Nukleinsäureerkennungs-Prinzipien. Neue Einsichten in die Erkennung solcher UAA durch PylRS wurden gewonnen, sowohl in funktioneller als auch struktureller Hinsicht. Mehrere der im Rahmen des Projektes etablierten Methoden und Materialien (z.B. Reporter Konstrukte und PylRS Bibliotheken) konnten auch in anderen Projekten genutzt werden.

Publications

• Red-light-controlled protein-RNA crosslinking with a genetically encoded furan Angew. Chem. Int. Ed., 2013, 52, 4690-93
  M. J. Schmidt, D. Summerer
  (See online at https://doi.org/10.1002/anie.201300754)
• A genetically encoded spin label for electron paramagnetic resonance distance measurements J. Am. Chem. Soc., 2014, 136, 1238-41
  M. J. Schmidt, J. Borbas, M. Drescher and D. Summerer
  (See online at https://doi.org/10.1021/ja411535q)
• Evolved sequence contexts for highly efficient amber suppression with noncanonical amino acids. ACS Chem Biol. 2014, 9(12), 2815-22
  M. Pott, M. J. Schmidt, D. Summerer
  (See online at https://doi.org/10.1021/cb5006273)
• Structural basis of furan-amino acid recognition by a polyspecific aminoacyl-tRNA-synthetase and its genetic encoding in human cells ChemBioChem, 2014
  M. J. Schmidt, A. Weber, M. Pott, W. Welte and D. Summerer
  (See online at https://doi.org/10.1002/cbic.201402006)