Transcriptomics des präimplantativen Rinderembryos
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Mit diesen Untersuchungen liegt erstmals das Transkriptionsprofil der Präimplantationsphase für in vivo gewonnene Embryonen des Rindes (Bos taurus) vor. Das Rind ist eine ökonomisch wichtige Spezies in der Agrarwirtschaft und wird zunehmend bedeutend als biomedizinisches Modell. Unsere Ergebnisse werden in der Zukunft dazu beitragen können, Ursachen für embryonale Frühmortalität zu identifizieren. Zudem wird das Rind in wachsendem Maße als Modell für Studien der humanen Präimplantationsphase genutzt. Als Limitierung der vorliegenden Untersuchungsergebnisse sind zu nennen, dass die Embryonen mit Hilfe einer milden Superovulationsbehandlung gewonnen werden mussten, da eine Einzel-Embryogewinnung nicht darstellbar ist. Es kann nicht völlig ausgeschlossen werden, dass es dadurch, insbesondere im Bereich der Oozyte zu Aberrationen im Transkriptionsprofil kommen kann. Bisher liegen dafür aber keine experimentellen Hinweise vor. Ferner ist zu betonen, dass die Gen-Ontologie-Informationen auf dem Affymetrix Chip noch nicht ganz vollständig sind und einige entwicklungsrelevante Gene nicht vorhanden sind. Die vorliegenden Daten haben aber gezeigt, dass das embryonale Genom durch hohe Plastizität und sehr hohe Dynamik gekennzeichnet ist, was bei zukünftigen Untersuchungen berücksichtigt werden muss.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
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(2007) Conserved molecular portraits of bovine and human blastocysts as a consequence of the transition from maternal to embryonic control of gene expression. Physiol. Genomics 31:315-327
Adjaye J, Herwig R, Brink TC, Herrmann D, Greber B, Sudheer S, Groth D, Carnwath JW, Lehrach H, Niemann H
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(2008) Genome-wide expression profiling reveals distinct clusters of transcriptional regulation during bovine preimplantation development in vivo. PNAS 105:19768-19773
Kues WA, Sudheer S, Herrmann D, Carnwath JW, Havlicek V, Besenfelder U, Lehrach H, Adjaye J, Niemann H