Kontrolle der Aktivität und Funktion von Proteinen mittels inhibitorinduzierten Konformationsänderungen (A09)

• Fachliche Zuordnung: Biochemie
• Förderung: Förderung von 2012 bis 2024
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 201302640

Caseinolytische Protease P (ClpP) ist eine bekannte Serinprotease, die für den Abbau fehlgefalteter Proteine verantwortlich ist. ClpP existiert als Tetradekamer in einer fassartigen Struktur, die in verschiedenen Konformationszuständen vorkommt. Wir haben das Ziel, das Auseinanderfallen des Komplexes mittels irreversibler Acyl-Enzym Intermediate aufzuklären. Diese sogenannten Traps werden uns erste Einblicke in das konformationelle Schalten der beta-Lactone sowie Phenylester Inhibitoren geben. Basierend auf unseren kürzlich erfolgten Arbeiten auf dem Gebiet der Listeria ClpP1/2 werden wir unsere Untersuchungen zur Funktion und dem Mechanismus auf ein verwandtes System in Pseudomonas mit ClpP1, ClpP2 und ClpP3 ausweiten, um zu verstehen, welche Prinzipien der konformationellen Kontrolle bei diesem komplexeren System verwendet werden. Zusammen vervollständigen diese Studien unser Verständnis dieser hochdynamischen Protease.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1035: Kontrolle von Proteinfunktion durch konformationelles Schalten
• Antragstellende Institution: Technische Universität München (TUM)
• Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter: Professor Dr. Stephan A. Sieber; Professorin Dr. Sevil Weinkauf, bis 6/2016 (†)