Liquid-Handling-Roboter für integrierte Hoch-Durchsatz-Screening-Station
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Im Modellorganismus Bäckerhefe (Saccharomyces cerevisiae) ist systematische genetische Analyse, d.h. das automatisierte Kreuzen von mutanten Stammsammlungen mit genetisch auf die wissenschaftliche Fragestellung hin veränderten Teststämmen, inzwischen ein Standardverfahren. Solche speziell auf das jeweilige Projekt angepaßte Stammkollektionen können dann mit Hilfe der automatisierten Mikroskopie durchgemustert werden. Die beschaffte vollintegrierte und intelligente High-Content Screening-Plattform erlaubt einerseits die Probenvorbereitung für die Mikroskopie (Vorlegen von Flüssigmedium in Multiwell- Platten, Zugabe von Substanzen) und enthält andererseits das automatisierte Mikroskop sowie eine direkt angekoppelte Datenspeicher-Einheit (HIVE). Das Gerät wird für systematische Screens von Hefestamm-Sammlungen genutzt, die jedes Protein des Hefeproteoms als fluoreszierendes Fusionsprotein exprimieren. Die bearbeiteten Fragestellungen stehen im Kontext der Biogenese, Sortierung und Qualitätskontrolle von Proteinen und zellulären Maschinerien. Die Automatisierung des Durchmusterungsprozesses und die halbautomatische, quantitative Bildanalyse mit der integrierten Analyse-Pipeline erlauben die zügige Durchführung von etlichen Screens als Teil eines Projektes (z.B. Promotionsvorhaben), in dem dann zusätzlich Raum für eine komplementäre biochemische Analyse von neu charakterisierten Komponenten und Prozessen bleibt. Daher ist das Gerät eine ideale Voraussetzung, um das volle Potential des Modellorganismus unter Verwendung moderner Methoden auszuschöpfen.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
- Mice lacking WRB reveal differential biogenesis requirements of tail-anchored proteins in vivo. Sci Rep. 2016 Dec 21;6:39464
Rivera-Monroy J, Musiol L, Unthan-Fechner K, Farkas Á, Clancy A, Coy-Vergara J, Weill U, Gockel S, Lin SY, Corey DP, Kohl T, Ströbel P, Schuldiner M, Schwappach B, Vilardi F
(Siehe online unter https://doi.org/10.1038/srep39464) - Two novel effectors of trafficking and maturation of the yeast plasma membrane H+ -ATPase. Traffic. 2017 Oct;18(10):672-682
Geva Y, Crissman J, Arakel EC, Gómez-Navarro N, Chuartzman SG, Stahmer KR, Schwappach B, Miller EA, Schuldiner M
(Siehe online unter https://doi.org/10.1111/tra.12503)
