Untersuchungen zur Funktion von neuen cis-regulatorischen Elementen in 3'UTRs von mRNAs und deren molekulare Mechanismen in der post-transkriptionalen Genexpression.

• Antragsteller: Dr. René Geißler
• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung von 2012 bis 2014
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 227338963

Die Genexpression wird durch eine Vielzahl an post-transkriptionalen Mechanismen reguliert, die letztendlich die Änderung der Menge an synthetisiertem Protein beeinflussen. Diese post-transkriptionale Regulation wird durch cis-regulatorische Sequenzelemente in den untranslatierten Regionen (UTRs) von mRNAs und trans-agierende Faktoren, die diese Elemente binden, vermittelt. Ein vergleichender Genom-übergreifender Ansatz führte zur Identifizierung hunderter potentiell neuer cis-regulatorischer Elemente innerhalb der 3‘UTRs. Obwohl verschiedene post-transkriptionale Regu-lationsmechanismen bereits entdeckt wurden, deutet die Präsenz von neuen cis-regulatorischen Ele-menten auf neue Mechanismen hin. Mit diesem Projekt sollen die zugrundeliegenden molekularen Mechanismen dieser Elemente identifiziert werden. Mit genetischen und biochemischen Ansätzen soll als Erstes die Wirkungsweise dieser Elemente in der Prozessierung, dem Export ins Cytoplasma, der subzellulären Lokalisierung, der Stabilität und der Translation von mRNAs bestimmt werden. Als Zwei-tes sollen die trans-agierenden Faktoren, voraussichtlich Proteine, die die Funktionen der cis-regulatorischen Elemente vermitteln, mit einem Genom-übergreifenden RNAi-basierten screening-Ansatz zusammen mit diesen Elementen identifiziert werden. Da diese Elemente in verschiedenen UTRs präsent sind, wird davon ausgegangen, dass neue post-transkriptionale Mechanismen und trans-agierende Faktoren entdeckt werden, die signifikant zur Regulation der Genexpression beitra-gen.

• DFG-Verfahren: Forschungsstipendien
• Internationaler Bezug: USA
• Gastgeber: Professor Dr. Andrew Grimson