Kommunikation und Protonierungsdynamik in Cytochrom-c-Oxidase in Abhängigkeit vom Redox-Zustand (C05)

• Fachliche Zuordnung: Biophysik
• Förderung: Förderung von 2014 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 221545957

Der Protonentransfer in Cytochrom-c-Oxidase entlang der sogenannten D- und K-Kanäle wird mit einer Kombination aus klassischen Molekulardynamiksimulationen und quantenchemischen Berechnungen erforscht. Diskrete Protonierungs- und Konformationszustände werden zu einem Übergangsnetzwerk verknüpft, und damit der wahrscheinlichste Protonentransferpfad bestimmt. Wir werden außerdem die Kommunikation innerhalb des Proteins, z.B. zwischen den beiden Kanälen, untersuchen. Des Weiteren soll der Einfluss des Redoxzustands auf diese Kommunikations- und auf die Protonentransferpfade erforscht werden um so ein umfassendes Bild der Kopplung von Redox-Reaktion und Protonierungsdynamik zu erhalten.

• DFG-Verfahren: Sonderforschungsbereiche
• Teilprojekt zu: SFB 1078: Proteinfunktion durch Protonierungsdynamik
• Antragstellende Institution: Freie Universität Berlin
• Teilprojektleiterin: Professorin Dr. Petra Imhof, bis 3/2019