Molekulare Mechanismen von long non-coding RNAs bei der Differenzierung von Kardiomyozyten

• Antragsteller: Professor Shizuka Uchida, Ph.D.
• Fachliche Zuordnung: Kardiologie, Angiologie ; Bioinformatik und Theoretische Biologie
• Förderung: Förderung von 2014 bis 2019
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 256131242

Aktuelle Studien gehen davon aus, dass bei Säugetieren über 98% der hergestellten RNA nicht für die Kodierung von Proteinen genutzt werden. Zu dieser Art von RNAs gehören auch die sogenannten "non-coding RNAs" (ncRNA). Aufgrund der physikalischen Eigenschaften der ncRNAs (z.B. Länge der Nukleotidkette, Lage zu einem bekanntem Gen, usw.) können sie in verschiedene Kategorien eingeteilt werden. Die Annotierungen der ncRNAs sind aufgrund ihrer häufig unbekannten Funktionen schwierig bzw. kaum vorhanden. Das vorgeschlagene Forschungsprojekt beabsichtigt die Funktionen von ncRNAs während der Differenzierung von Kardiomyozyten aus Stammzellen, mithilfe von bioinformatischen- und molekularbiologischen Techniken, zu erklären. Die Identifizierung von unbekannten ncRNAs während der Herzentwicklung könnte dazu beitragen ncRNAs besser zu annotieren und die Zusammenhänge im Transkriptom tiefgreifender zu verstehen. Das Langzeitziel dieses Projekts ist es epigenetische Einflüsse bei der Herzentwicklung besser zu verstehen und einen effizienteren Weg zu finden um aus Stammzellen funktionierende Kardiomyocyten zu gewinnen. Dies könnte in der regenerativen Medizin Anwendung finden.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen