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Transmissionselektronenmikroskop mit integriertem Fluoreszenzmikroskop

Subject Area Zoology
Term Funded in 2014
Project identifier Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 257055367
 
Final Report Year 2018

Final Report Abstract

Das Gerät wird im Rahmen der Elektronenmikroskopie und Histologie Facility (CRTD/BIOTEC) betrieben. Diese ist Bestandteil der Technologie-Plattform des Center for Molecular and Cellular Bioengineering (CMCB), eines Zusammenschlusses der Institute BIOTEC, CRTD und ZIK-BCUBE. Die 2008 etablierte Facility stellt wissenschaftliche Expertise und qualitativ hochwertige Geräte für die ultrastrukturelle Analyse von Zellen, Geweben und Materialien zur Verfügung. Neben dem Zugang zu Probenpräparationstechnologie und zu Elektronenmikroskopen bietet die Facility wissenschaftliche Services auf dem Gebiet der Probenpräparation, der Datenaquise und der Datenauswertung, meist in Kollaboration mit den Arbeitsgruppen aus BIOTEC, BCUBE, ZIK-BCUBE sowie weiteren Instituten der TUD. Das geförderte Gerät wird überwiegend für die ultrastrukturelle Analyse von Zellen und Geweben, insbesondere für die korrelative Licht- und Elektronenmikroskopie (CLEM), in Projekten von über 20 Gruppen am Campus verwendet. Das Spektrum der mit dem Gerät analysierten Proben reicht von isolierten Zellorganellen, Zellkulturen, Geweben, Organoiden, Embryonen, kleinen Organsimen, und Materialien (z.B. Hydrogele), die mit Zellen oder Zellgruppen assoziiert sind. Darüber hinaus wurde das Gerät auch zur Entwicklung und/oder Etablierung technisch anspruchsvoller Präparationstechniken und Methoden genutzt. So konnte unter anderem die korrelative Licht- und Elektronenmikroskopie (CLEM) von ultradünnen Kunststoff und Gefrierschnitten mit verschiedenen Immunmarkierungsprotokollen etabliert und in einer Reihe von Projekten angewendet werden. Das Gerät wurde auch zur Etablierung einer automatisierten und korrelativen Immunmarkierungsmethode für hunderte ultradünne Schnitte zur 3D-Rekonstruktion von Zielzellen/- strukturen in Geweben verwendet (serial section CLEM, ssCLEM), sowie für die Entwicklung neuer auf DNA-Origami-Basis beruhender korrelativer Marker (DNA-Origami-Barcode) zur multiplen simultanen Markierung verschiedener Zelltypen auf einem einzigen Schnitt.

Publications

  • (2018) Reconstituting the formation of hierarchically porous silica patterns using diatom biomolecules. Journal of structural biology 204 (1) 64–74
    Pawolski, Damian; Heintze, Christoph; Mey, Ingo; Steinem, Claudia; Kröger, Nils
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.jsb.2018.07.005)
  • (2018) VAMP-associated protein-A and oxysterol-binding protein–related protein 3 promote the entry of late endosomes into the nucleoplasmic reticulum. Journal of Biological Chemistry 293 (36) 13834-13848
    Santos MF, Rappa G, Karbanova J, Kurth T,
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  • (2016) IL4/STAT6 signaling activates neural stem cell proliferation and neurogenesis upon amyloidß42 aggregation in adult zebrafish brain. Cell Reports 17, 941-948
    Bhattarai P, Thomas AK, Cosacak MI, Papadimitriou C, Mashkaryan V, Froc C, Reinhardt S, Kurth T, Dahl A, Zhang Y, Kizil C
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.celrep.2016.09.075)
  • (2016) RPA and Rad51 constitute a cell intrinsic mechanism to protect the cytosol from self DNA. Nature Communications 7, 11752
    Wolf C, Rapp A, Berndt N, Staroske W, Schuster M, Dobrick-Mattheuer M, Kretschmer S, König N, Kurth T, Wieczorek D, Kast K, Cardoso MC, Günther C, Lee-Kirsch MA
    (See online at https://doi.org/10.1038/ncomms11752)
  • (2017) A global approach for quantitative super resolution and electron microscopy on cryo and epoxy sections using self-labeling protein tags. Scientific Reports 7, 23
    Müller A, Neukam M, Ivanova A, Sönmez A, Münster C, Kretschmar S, Kalaidzidis Y, Kurth T, Verbavatz JM, Solimena M
    (See online at https://doi.org/10.1038/s41598-017-00033-x)
  • (2017) Enhanced targeting of invasive glioblastoma cells by peptide-functionalized gold nanorods in hydrogelbased 3D cultures. Acta Biomaterilia 58, 12-25
    Goncalves DPN, Rodriguez RD, Kurth T, Bray LJ, Binner M, Jungnickel C, Gür FN, Poser SW, Schmidt TL, Zahn DRT, Androutsellis-Theotokis A, Schlierf M, Werner C
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.actbio.2017.05.054)
  • (2017) The enigmatic meiotic dense body and its newly discovered component, SCML1, are dispensible for fertility and gametogenesis in mice. Chromosoma 126, 399-415
    Papanikos F, Daniel K, Goercharn-Ramlal A, Fei JF, Kurth T, Wojtasz L, Dereli I, Fu J, Penninger J, Habermann B, Surani A, Stewart AF, Toth A
    (See online at https://doi.org/10.1007/s00412-016-0598-1)
  • (2018) Coacervation-mediated combinatorial synthesis of biomatrices for stem cell culture and directed differentiation. Advanced Materials 30(22):e1706100
    Wieduwild R, Wetzel R, Husman D, Bauer S, El- Sayed I, Duin S, Murawala P, Thomas AK, Wobus M, Bornhäuser M, Zhang Y
    (See online at https://doi.org/10.1002/adma.201706100)
  • (2018). 3D culture method for Alzheimer’s disease modeling reveals interleukin-4 rescues Aß42-induced loss of human neural stem cell plasticity. Developmental Cell 46, 85-110
    Papadimitriou C, Celikkaya H, Cosacak MI, Mashkaryan V, Bray L, Bhattarai P, Brandt K, Hollak H, Chen X, He S, Antos CL, Lin W, Thomas AK, Dahl A, Kurth T, Friedrichs J, Zhang Y, Freudenberg U, Werner C, Kizil C
    (See online at https://doi.org/10.1016/j.devcel.2018.06.005)
  • (2018). Non-covalently assembled electroconductive hydrogel. ACS Applied Materials Interfaces 10, 14418-14425
    Xu Y, Yang X, Thomas AK, Patsis PA, Kurth T, Kraeter M, Eckert K, Bornhaeuser M, Zhang Y
    (See online at https://doi.org/10.1021/acsami.8b01029)
 
 

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