Mehrstufen-Coarse-Graining von Multiskalenproblemen (B03)

Wir werden mehrstufige Coarse-Graining-Methoden entwickeln, die die effektive Dynamik mehrskaliger Molekülsysteme bewahren, und sie auf komplexe molekulare Vorgänge wie z.B. Peptidaggregation anwenden. Unser Ansatz integriert eine neuartige Identifizierung optimaler Reaktionskoordinaten mittels tiefem Lernen mit einem mehrdimensionalen verallgemeinerten Langevin-Modell mit nichtlinearer Reibung, und auf Force Matching basierenden molekularen Coarse-Graining-Methoden. Als Anwendung werden wir den Aggregationsprozess des Islet-Amyloid-Polypeptids untersuchen und unsere Ergebnisse experimentell validieren.

DFG-Verfahren Sonderforschungsbereiche

Teilprojekt zu SFB 1114:  Skalenkaskaden in komplexen Systemen

Antragstellende Institution Freie Universität Berlin

Teilprojektleiterinnen / Teilprojektleiter Professorin Cecilia Clementi, Ph.D., seit 7/2022; Professorin Dr. Beate Koksch; Professor Dr. Ralf Kornhuber, bis 6/2018; Professor Dr. Roland Netz; Professor Dr. Christof Schütte