Entwicklung und Erprobung eines neuen Ansatzes zur Schätzung der effektiven Populationsgröße auf der Basis der Homozygotie von Chromosomensegmenten

• Antragsteller: Professor Dr. Henner Simianer; Professor Dr. Steffen Weigend
• Fachliche Zuordnung: Tierzucht, Tierernährung, Tierhaltung
• Förderung: Förderung von 2006 bis 2010
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 26068496

Die effektive Populationsgröße ist ein zentraler, aber schwierig zu schätzender Parameter der Populationsgenetik. In geschlossenen Populationen strebt die Homozygotierate von Chromosomensegmenten einem asymptotischen Gleichgewichtswert zu, der funktional von der Länge des Chromosomensegments und von der effektiven Populationsgröße abhängig ist. Dieser Zusammenhang soll genutzt werden, um aus der beobachteten Homozygotiefrequenz für Segmente bekannter Länge die effektive Populationsgröße zu schätzen. Nach der theoretischen Ausarbeitung des Schätzverfahrens und der analytischen Untersuchung der Eigenschaften des vorgeschlagenen Schätzers soll dieser sowohl an simulierten als auch an realen Daten erprobt werden. Hierzu stehen zwei experimentelle und zwei kommerzielle Hühnerlinien zur Verfügung. Für diese soll für jeweils eine historische (aus den Jahren 1998/99) und eine aktuelle Stichprobe ein Set von 8 Chromosomensegmenten ä 6 Mikrosatellitenmarker typisiert werden, An diesen Daten werden alle beschriebenen Verfahren zur Schätzung der effektiven Populationsgröße einschließlich des vorgeschlagenen neuen Verfahrens genutzt und die Ergebnisse gegenübergestellt. Die Studie soll dazu beitragen, robuste markergestützte Verfahren zur Schätzung der effektiven Populationsgröße aus Ein-Generationen-Stichproben zu entwickeln.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen