Identifizierung von RNA Editing Faktoren in Pflanzen durch EMS-Mutanten

• Antragsteller: Professor Dr. Stefan Binder, seit 11/2017
• Fachliche Zuordnung: Genetik und Genomik der Pflanzen ; Pflanzenphysiologie
• Förderung: Förderung von 2014 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 262645124

In diesem Projekt sollen weitere im Zellkern kodierte Faktoren für das RNA Editing in Mitochondrien und Plastiden von Pflanzen mit dem gezielten genetischen Screen von EMS-mutierten Populationen von Arabidopsis thaliana gesucht werden. Die in der vorigen Förderperiode erfolgreiche Identifizierung mehrerer neuer PPR Gene und die Aufklärung der Beteiligung der neuen Familie der MORF Proteine mit diesem SNaPshot Mutantenscreen hat gezeigt, dass dieser Ansatz sehr gut geeignet ist, solche Faktoren zu finden. Die weitergehende Arbeit in der hier beantragten zweiten Phase beinhaltet die Suche nach dem bislang unbekannten Enzym und nach weiteren Genen für PPR und andere Proteine, die am RNA Editing beteiligt sind. Die Identifizierung neuer EMS-Punktmutationen in bekannten PPR Proteinen wird wesentlich dazu beitragen, die Funktion der einzelnen PPR Proteindomänen aufzuklären. In parallelen Ansätzen werden die Funktionen von mitochondrial kodierten Proteinen untersucht. Dazu sollen mit Kombinationen von spezifischen Editing Proteinen Doppelmutanten als Knock-out und/oder Knock-down Mutanten z.B. mit amiRNA in einzelnen mitochondrialen Proteinen in vivo hergestellt werden, um ihre Funktion genauer zu untersuchen. So soll zum Beispiel die Funktion des Intron-kodierten matR Gens aufgeklärt werden.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen
• Ehemaliger Antragsteller: Privatdozent Dr. Mizuki Takenaka, bis 11/2017