Entwicklung peptoidbasierter Histon-Deacetylase-Inhibitoren mit antiplasmodialer Aktivität gegen mehrere parasitäre Entwicklungsstadien
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Malaria ist nach wie vor ein großes globales Gesundheitsproblem, wobei Plasmodium falciparum die Hauptursache für die meisten schweren Fälle und Todesfälle ist. Da die Resistenz gegen die derzeitigen Malariamedikamente, insbesondere gegen Artemisinin-basierte Kombinationstherapien (ACT), weiter zunimmt, besteht ein dringender Bedarf an neuen therapeutischen Ansätzen. Ein vielversprechender Ansatz ist die Verwendung von Histon-Deacetylase-Inhibitoren (HDACi), die ursprünglich für die Krebsbehandlung entwickelt wurden, da sie potente antiplasmodiale Eigenschaften besitzen. Histondeacetylasen (HDACs), die sowohl beim Menschen als auch bei Plasmodium-Arten vorkommen, regulieren die Genexpression durch Modulation der Acetylierung von Histonen und anderen Proteinen. In früheren Forschungsarbeiten wurden mehrere HDACi identifiziert, die zwar eine starke antiplasmodiale Wirkung haben, aber nur begrenzt selektiv sind und eine geringe metabolische Stabilität aufweisen. In diesem Projekt wurde die Hypothese aufgestellt, dass selektive Inhibitoren der humanen HDAC6 eine vielversprechende Grundlage für die Entwicklung parasitenselektiver Antimalariamittel sein könnten. Während der ersten Förderphase erwiesen sich unsere peptoidbasierten HDAC6-Inhibitoren als potente und selektive antiplasmodiale HDACi, die sowohl gegen Chloroquin-sensitive als auch -resistente asexuelle Blutstadien von P. falciparum wirksam sind. Ferner zeigten mehrere Verbindungen eine submikromolare Aktivität gegen Leberstadien. Während des zweiten Förderzeitraums wurden drei medizinalchemische Strategien zur Optimierung verfolgt: 1. Ersatz der zinkbindenden Gruppe (ZBG): Es wurden zehn alternative ZBGs getestet, doch die meisten Varianten verringerten die antiplasmodiale Aktivität. Die erfolgreichste Verbindung, DS-103, zeigte nur eine mäßige antiplasmodiale Aktivität, erwies sich jedoch als vielversprechender Kandidat für die Entwicklung von antitumoralen HDACi. 2. Optimierung des Linkers und der Kopfgruppe: Die Modifikationen führten zu Verbindungen wie Cpd. 1h und Cpd. 6i, die eine niedrige nanomolare Aktivität gegen asexuelle Blutstadien von P. falciparum, eine submikromolare Aktivität gegen Leberstadien, eine hohe metabolische Stabilität, eine niedrige Zytotoxizität und eine hohe Selektivität gegenüber Parasiten aufwiesen. Scaffold Hopping auf der Grundlage von Quisinostat führte zu einer neuen Reihe von Verbindungen, darunter Cpd. 18b, die eine hochwirksame und selektive antiplasmodiale Aktivität aufwiesen. 3. Dihydroartemisinin-HDACi Hybride: Diese Verbindungen zeigten eine starke nanomolare antiplasmodiale Aktivität, auch gegen Artemisinin-resistente Parasiten. Insbesondere das Hybrid (α)-7c zeigte im Vergleich zu Dihydroartemisinin allein eine erhöhte Wirksamkeit gegen Artemisinin-resistente Parasiten. Zusammenfassend lässt sich sagen, dass dieses Projekt potente, metabolisch stabile und selektive antiplasmodiale HDACi hervorgebracht hat. Diese sind vielversprechende Ausgangspunkte für die weitere Entwicklung von Wirkstoffen gegen Malaria. Bislang wurden die Ergebnisse der beiden Förderperioden des Projekts in 11 Publikationen und einem Preprint veröffentlicht. Eine weitere Veröffentlichung, die den neu entwickelten Gametozyten-Assay zusammenfasst und die künftigen Screening-Möglichkeiten verbessern soll, ist für Ende 2025 vorgesehen.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
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Design and Synthesis of Terephthalic Acid‐Based Histone Deacetylase Inhibitors with Dual‐Stage Anti‐Plasmodium Activity. ChemMedChem, 12(19), 1627-1636.
Stenzel, Katharina; Chua, Ming Jang; Duffy, Sandra; Antonova‐Koch, Yevgeniya; Meister, Stephan; Hamacher, Alexandra; Kassack, Matthias U.; Winzeler, Elizabeth; Avery, Vicky M.; Kurz, Thomas; Andrews, Katherine T. & Hansen, Finn K.
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Multicomponent Synthesis and Binding Mode of Imidazo[1,2-a]pyridine-Capped Selective HDAC6 Inhibitors. Organic Letters, 20(11), 3255-3258.
Mackwitz, Marcel K. W.; Hamacher, Alexandra; Osko, Jeremy D.; Held, Jana; Schöler, Andrea; Christianson, David W.; Kassack, Matthias U. & Hansen, Finn K.
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One-pot, multi-component synthesis and structure-activity relationships of peptoid-based histone deacetylase (HDAC) inhibitors targeting malaria parasites. European Journal of Medicinal Chemistry, 158, 801-813.
Diedrich, Daniela; Stenzel, Katharina; Hesping, Eva; Antonova-Koch, Yevgeniya; Gebru, Tamirat; Duffy, Sandra; Fisher, Gillian; Schöler, Andrea; Meister, Stephan; Kurz, Thomas; Avery, Vicky M.; Winzeler, Elizabeth A.; Held, Jana; Andrews, Katherine T. & Hansen, Finn K.
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Histone deacetylase inhibitors with high in vitro activities against Plasmodium falciparum isolates collected from Gabonese children and adults. Scientific Reports, 9(1).
Koehne, Erik; Kreidenweiss, Andrea; Zoleko Manego, Rella; McCall, Matthew; Mombo-Ngoma, Ghyslain; Mackwitz, Marcel Karl Walter; Hansen, Finn K. & Held, Jana
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Structure–Activity and Structure–Toxicity Relationships of Peptoid‐Based Histone Deacetylase Inhibitors with Dual‐Stage Antiplasmodial Activity. ChemMedChem, 14(9), 912-926.
Mackwitz, Marcel K. W.; Hesping, Eva; Antonova‐Koch, Yevgeniya; Diedrich, Daniela; Woldearegai, Tamirat Gebru; Skinner‐Adams, Tina; Clarke, Mary; Schöler, Andrea; Limbach, Laura; Kurz, Thomas; Winzeler, Elizabeth A.; Held, Jana; Andrews, Katherine T. & Hansen, Finn K.
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Investigation of the in vitro and in vivo efficacy of peptoid-based HDAC inhibitors with dual-stage antiplasmodial activity. European Journal of Medicinal Chemistry, 211, 113065.
Mackwitz, Marcel K.W.; Hesping, Eva; Eribez, Korina; Schöler, Andrea; Antonova-Koch, Yevgeniya; Held, Jana; Winzeler, Elizabeth A.; Andrews, Katherine T. & Hansen, Finn K.
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Synthesis, Antiplasmodial, and Antileukemia Activity of Dihydroartemisinin–HDAC Inhibitor Hybrids as Multitarget Drugs. Pharmaceuticals, 15(3), 333.
von Bredow, Lukas; Schäfer, Thomas Martin; Hogenkamp, Julian; Tretbar, Maik; Stopper, Daniel; Kraft, Fabian B.; Schliehe-Diecks, Julian; Schöler, Andrea; Borkhardt, Arndt; Bhatia, Sanil; Held, Jana & Hansen, Finn K.
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The problem of antimalarial resistance and its implications for drug discovery. Expert Opinion on Drug Discovery, 19(2), 209-224.
Schäfer, Thomas Martin; Pessanha de Carvalho, Lais; Inoue, Juliana; Kreidenweiss, Andrea & Held, Jana
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Development of peptoid-based heteroaryl-decorated histone deacetylase (HDAC) inhibitors with dual-stage antiplasmodial activity. European Journal of Medicinal Chemistry, 277, 116782.
Stopper, Daniel; de Carvalho, Lais Pessanha; de Souza, Mariana Laureano; Kponomaizoun, Cindy-Esther; Winzeler, Elizabeth A.; Held, Jana & Hansen, Finn K.
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Exploration of fluorinated peptoid-based histone deacetylase inhibitors as dual-stage antiplasmodial agents. American Chemical Society (ACS).
Reßing, Nina; Stopper, Daniel; Schäfer, Thomas Martin; de Carvalho, Lais Pessanha; Winzeler, Elizabeth; Held, Jana & Hansen, Finn Kristian
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Exploring Alternative Zinc-Binding Groups in Histone Deacetylase (HDAC) Inhibitors Uncovers DS-103 as a Potent Ethylhydrazide-Based HDAC Inhibitor with Chemosensitizing Properties. Journal of Medicinal Chemistry, 68(4), 4426-4452.
Stopper, Daniel; Biermann, Lukas; Watson, Paris R.; Li, Jingyu; König, Beate; Gaynes, Matthew N.; Pessanha de Carvalho, Lais; Klose, Jana; Hanl, Maria; Hamacher, Alexandra; Schäker-Hübner, Linda; Ramsbeck, Daniel; Held, Jana; Christianson, David W.; Kassack, Matthias U. & Hansen, Finn K.
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Multicomponent syntheses enable the discovery of novel quisinostat-derived chemotypes as histone deacetylase inhibitors. European Journal of Medicinal Chemistry, 281, 117045.
Stopper, Daniel; Buntrock, Susanna; Tan, Kathrin; de Carvalho, Lais Pessanha; Schäker-Hübner, Linda; Held, Jana; Kassack, Matthias U. & Hansen, Finn K.
