RNA-Protein-Interaktionen für das Lesen des Hefe mRNP-Codes

• Antragsteller: Dr. Falk Butter
• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung ; Biochemie
• Förderung: Förderung von 2016 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 313087757

Unter Einsatz von Massenspektrometrie möchten wir in diesem Antrag Proteine identifizieren, die an einzelne, definierte RNA-Strukturen binden und mit Hilfe der gewonnen quantitativen Interaktionsdaten ein RNA-Protein-Netzwerk beschreiben. Im Detail werden wir unsere RNA-Protein-Interaktionsanalysen einsetzen, um RNA-bindende Proteine an phylogenetisch konservierten mRNA-Strukturen sowie RNA-abhängige mRNP-Komplexe in der Hefe aufzuklären. Neben der systematischen Beschreibung der Funktionalität dieser RNA-bindenden Proteine auf systembiologischer Ebene in der von uns verwendeten Hefe, kann unsere Technik aufgrund ihres Durchsatzes und breiten Anwendbarkeit auch für jegliche anderen RNA-Strukturen in verschiedensten Organismen verwendet werden. Deshalb kann unser Ansatz auch zur Aufklärung des mRNP-Codes in anderen Modellorganismen beitragen.

• DFG-Verfahren: Schwerpunktprogramme
• Teilprojekt zu: SPP 1935: Deciphering the mRNP code: RNA-bound determinants of post-transcriptional gene regulation