Funktionelle Charakterisierung des DNA-Sensors DDX41 und des Mediators STING, die an der angeborenen Immunantwort auf zytosolische DNA und zyklische Dinukleotide involviert sind

• Antragstellerin: Dr. Alexandra-Zoi Andreou
• Fachliche Zuordnung: Biochemie
• Förderung: Förderung von 2016 bis 2020
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 313913397

Die Erkennung von DNA im Zytosol führt zur Interferonproduktion. Das DEAD-Box Protein DDX41 ist als einer der beteiligten DNA-Sensoren identifiziert worden. STING ist ein membrangebundenes Protein, das als Vermittler zwischen den DNA-Sensoren und der Aktivierung der Immunantwort durch Interferon agiert. Die beiden Proteine sind zusätzlich an der angeborenen Immunantwort einer Zelle auf zyklische Dinukleotide beteiligt. Bislang ist es unklar, wie DDX41 und STING aktiviert werden und miteinander interagieren. Wir möchten DDX41 in vitro in Bezug auf die Erkennung von DNA und zyklischer Dinukleotide und die mit der Bindung der Liganden einhergehenden Konformationsänderungen charakterisieren. Zusätzlich werden wir biochemische und biophysikalische Methoden zusammen mit Einzelmolekülfluoreszenzspektroskopie anwenden, um die STING-Aktivierung auf molekularer Ebene zu untersuchen. Im Einzelnen möchten wir I) die Ligand-induzierte Dimerisierung/Oligomerisierung von STING näher beleuchten II) die Konformationsänderungen der zytosolischen Domäne und des C-terminale Endes von STING mit der Binding von zyklischem Dinukleotid verfolgen und III) die STING-DDX41 Interaktion näher betrachten, um klären zu können, wie STING durch die Bindung von DNA Sensoren aktiviert wird.

• DFG-Verfahren: Sachbeihilfen