Zu einem hochaufgelösten Bild der Stabilität von Proteinablagerungen und deren Modulation in neurodegenerativen Erkrankungen: Visualisierung des Unsichtbaren durch Fluor-NMR-Dynamik
Biophysik
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Die Alzheimer-Krankheit (AK) ist die häufigste Ursache von Demenz und stellt eine zunehmende Belastung für unsere alternde Gesellschaft dar. Dem fortschreitenden klinischen Verlauf der AK geht eine lange präklinische Phase voraus, in der sich die neuropathologischen Merkmale der AK, z. B. die extrazelluläre Ablagerung von Amyloid-β (Aβ) Peptid, allmählich entwickeln. Mehrere Hinweise deuten auf die Schlüsselrolle der Aβ-Aggregation als auslösendes Ereignis in der AK-Pathogenese hin. Ein bemerkenswertes Merkmal der AK ist die große Heterogenität ihres neuropathologischen und klinischen Verlaufs, für den die genauen zugrunde liegenden molekularen Faktoren nicht gut verstanden sind. In diesem Projekt haben wir erstens einen neuen integrativen Ansatz entwickelt, der NMR und andere biophysikalische Techniken kombiniert und ein detailliertes Bild der Dynamik von Aβ-Monomeren liefert, was die entscheidende Bedeutung eines kinetischen Gleichgewichts zwischen verschiedenen Aβ- Bewegungsarten für die Aggregation hervorhebt und als Referenz für weitere mechanistische Studien in diesem Projekt dient. Zweitens lieferten wir Beweise für die mechanistische Rolle zweier kurzer Aβ-Segmente bei der frühen Aggregation, dem Gly33-Leu34-Met35-Segment im C-terminalen Teil und den Arg5-basierten Salzbrücken im N-terminalen Teil, und schlugen sie als potenzielle Angriffspunkte für die Entwicklung von Anti-AD-Medikamenten vor. Drittens haben wir mit Hilfe der Hochdruck-NMR nachgewiesen, dass einige Mutationen in Aβ (E22G, D23N und ΔE22) die Druckstabilität von Aβ-Fibrillen auf drastisch unterschiedliche Weise verändern, und haben die "Stabilitätsvariation" als eine molekulare Eigenschaft vorgeschlagen, die möglicherweise zu der bemerkenswerten neuropathologischen Vielfalt bei familiärer AK beiträgt. Viertens zeigten wir, dass sich die Druckstabilität von Aβ-Fibrillen während der Invitro-Alterung verändert und schlugen vor, dass die "Stabilitätsreifung" von Aβ-Fibrillen bei der Entwicklung von molekularen Bildgebungssonden gegen Aβ-Fibrillen berücksichtigt werden sollte. Fünftens haben wir durch mathematische Modellierung gezeigt, dass das gekoppelte Aβ-Aggregations-Entzündungs-System eine hohe Tendenz zu anhaltenden Oszillationen hat, und vorgeschlagen, dass solche anhaltenden Oszillationen den Übergang zu einer progressiveren Phase der Amyloid-Pathologie in der präklinischen AK markieren und daher möglicherweise als früher Biomarker der AK verwendet werden könnten. Weitere mechanistische Erkenntnisse über die Aβ-Aggregation werden nach Abschluss der Analyse der Fluor-NMR-Daten vorliegen. Außerdem führte unser Projekt zu einigen Entwicklungen von NMR-Methoden, insbesondere in den Bereichen Quadrupolar-, Singlet-State- und Fluor-NMR, die zur Entschlüsselung der Peptid-, Wasser- und Ionendynamik sowie der Kinetik des Komponentenaustauschs in Systemen, die einer Aggregation und Phasentrennung unterliegen, eingesetzt wurden.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
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Local and Global Dynamics in Intrinsically Disordered Synuclein. Angewandte Chemie International Edition, 57(46), 15262-15266.
Rezaei‐Ghaleh, Nasrollah; Parigi, Giacomo; Soranno, Andrea; Holla, Andrea; Becker, Stefan; Schuler, Benjamin; Luchinat, Claudio & Zweckstetter, Markus
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A facile oxygen-17 NMR method to determine effective viscosity in dilute, molecularly crowded and confined aqueous media. Chemical Communications, 55(82), 12404–12407.
Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Munari, Francesca; Becker, Stefan; Assfalg, Michael & Griesinger, Christian
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Lysine/RNA-interactions drive and regulate biomolecular condensation. Nature Communications, 10(1).
Ukmar-Godec, Tina; Hutten, Saskia; Grieshop, Matthew P.; Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Cima-Omori, Maria-Sol; Biernat, Jacek; Mandelkow, Eckhard; Söding, Johannes; Dormann, Dorothee & Zweckstetter, Markus
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Reorientational Dynamics of Amyloid-β from NMR Spin Relaxation and Molecular Simulation. The Journal of Physical Chemistry Letters, 10(12), 3369-3375.
Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Parigi, Giacomo & Zweckstetter, Markus
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Biomolecular phase separation through the lens of sodium‐23 NMR. Protein Science, 30(7), 1315-1325.
Fuentes‐Monteverde, Juan Carlos; Becker, Stefan & Rezaei‐Ghaleh, Nasrollah
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Multiple Protective Roles of Nanoliposome‐Incorporated Baicalein against Alpha‐Synuclein Aggregates. Advanced Functional Materials, 31(7).
Aliakbari, Farhang; Mohammad‐Beigi, Hossein; Abbasi, Shahsanam; Rezaei‐Ghaleh, Nasrollah; Lermyte, Frederik; Parsafar, Soha; Becker, Stefan; Tafreshi, Azita Parvaneh; O.'Connor, Peter B.; Collingwood, Joanna F.; Christiansen, Gunna; Sutherland, Duncan S.; Jensen, Poul Henning; Morshedi, Dina & Otzen, Daniel E.
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Singlet-filtered NMR spectroscopy. Science Advances, 6(8).
Mamone, Salvatore; Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Opazo, Felipe; Griesinger, Christian & Glöggler, Stefan
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Combined High-Pressure and Multiquantum NMR and Molecular Simulation Propose a Role for N-Terminal Salt Bridges in Amyloid-Beta. The Journal of Physical Chemistry Letters, 12(40), 9933-9939.
Vemulapalli, Sahithya Phani Babu; Becker, Stefan; Griesinger, Christian & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Early Divergence in Misfolding Pathways of Amyloid‐Beta Peptides. ChemPhysChem, 22(21), 2158-2163.
Mamone, Salvatore; Glöggler, Stefan; Becker, Stefan & Rezaei‐Ghaleh, Nasrollah
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Dynamical component exchange in a model phase separating system: an NMR-based approach. Physical Chemistry Chemical Physics, 24(10), 6169-6175.
Pantoja, Christian F.; Zweckstetter, Markus & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Metal Binding to Sodium Heparin Monitored by Quadrupolar NMR. International Journal of Molecular Sciences, 23(21), 13185.
Sieme, Daniel; Griesinger, Christian & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Molecular Diffusivity of Click Reaction Components: The Diffusion Enhancement Question. Journal of the American Chemical Society, 144(3), 1380-1388.
Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Agudo-Canalejo, Jaime; Griesinger, Christian & Golestanian, Ramin
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Polyphenols-Based Nanosheets of Propolis Modulate Cytotoxic Amyloid Fibril Assembly of α-Synuclein. ACS Chemical Neuroscience, 13(22), 3168-3179.
Rafiei, Yasin; Salmani, Bahram; Mirzaei-Behbahani, Behnaz; Taleb, Mahshid; Meratan, Ali Akbar; Ramezani, Mohammad; Nikfarjam, Nasser; Becker, Stefan & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Response to Comment on “Following Molecular Mobility during Chemical Reactions: No Evidence for Active Propulsion” and “Molecular Diffusivity of Click Reaction Components: The Diffusion Enhancement Question”. Journal of the American Chemical Society, 144(30), 13441-13445.
Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Agudo-Canalejo, Jaime; Griesinger, Christian & Golestanian, Ramin
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The calcium-free form of atorvastatin inhibits amyloid-β(1–42) aggregation in vitro. Journal of Biological Chemistry, 298(3), 101662.
Nedaei, Hadi; Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Giller, Karin; Becker, Stefan; Karami, Leila; Moosavi-Movahedi, Ali Akbar; Griesinger, Christian & Saboury, Ali Akbar
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Water Dynamics in Highly Concentrated Salt Solutions: A Multi‐Nuclear NMR Approach. ChemistryOpen, 11(6).
Rezaei‐Ghaleh, Nasrollah
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Autoinhibition in the Signal Transducer CIN85 Modulates B Cell Activation. Journal of the American Chemical Society, 146(1), 399-409.
Sieme, Daniel; Engelke, Michael; Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Becker, Stefan; Wienands, Jürgen & Griesinger, Christian
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Familial Alzheimer’s Disease-Related Mutations Differentially Alter Stability of Amyloid-Beta Aggregates. The Journal of Physical Chemistry Letters, 14(6), 1427-1435.
Rezaei-Ghaleh, Nasrollah; Amininasab, Mehriar; Giller, Karin & Becker, Stefan
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Fast Motions Dominate Dynamics of Intrinsically Disordered Tau Protein at High Temperatures. Chemistry – A European Journal, 29(17).
Abyzov, Anton; Mandelkow, Eckhard; Zweckstetter, Markus & Rezaei‐Ghaleh, Nasrollah
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Maturation of amyloid β fibrils alters their molecular stability. Physical Chemistry Chemical Physics, 25(22), 15099-15103.
Becker, Stefan; Giller, Karin; Sieme, Daniel & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Bifurcations in coupled amyloid-β aggregation-inflammation systems. npj Systems Biology and Applications, 10(1).
Chakrabarti, Kalyan S.; Bakhtiari, Davood & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Large dynamics of a phase separating arginine-glycine-rich domain revealed via nuclear and electron spins. Nature Communications, 15(1).
Sicoli, Giuseppe; Sieme, Daniel; Overkamp, Kerstin; Khalil, Mahdi; Backer, Robin; Griesinger, Christian; Willbold, Dieter & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Mobility of sodium ions in agarose gels probed through combined single- and triple-quantum NMR. Methods, 228, 55-64.
Nimerovsky, Evgeny; Sieme, Daniel & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
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Water dynamics in eutectic solutions of sodium chloride and magnesium sulfate: implications for life in Europa's subsurface ocean and ice shell. Physical Chemistry Chemical Physics, 26(1), 105-115.
Sieme, Daniel & Rezaei-Ghaleh, Nasrollah
