Chromatin profiling of dREAM and dNuRD complexes

• Antragsteller: Professor Dr. Alexander Brehm
• Fachliche Zuordnung: Allgemeine Genetik und funktionelle Genomforschung
• Förderung: Förderung von 2007 bis 2010
• Projektkennung: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Projektnummer 5470729

Die Regulation der Chromatinstruktur spielt eine fundamentale Rolle bei Differenzierung, Proliferation und Transformation von Zellen. Zwar sind mehrere chromatinregulierende Proteinkomplexe bekannt, aber wir wissen wenig darüber, wie sie zusammenwirken. dREAM and dNuRD sind hochkonservierte Proteinkomplexe. Humane Homologe der dREAM und dNuRD Untereinheiten, wie das Retinoblastoma Tumorsuppressorprotein pRb und die metastase-assoziierten Proteine MTA1-3, sind in Krebszellen dereguliert. In C.elegans kooperieren beide Komplexe bei Differenzierungsprozessen während der Entwicklung. Man vermutet, daß sie Transkription reprimieren, indem sie auf die Chromatinstruktur einwirken. Hier wollen wir neue Microarray-Methoden verwenden (ChlP-onchip, DarnlD, RNAi/Microarray), um genomweit Bindungsstellen und Zielgene von dREAM und dNuRD zu bestimmen. Wir streben an, Gene, die von beiden Komplexen koreguliert werden zu identifizieren und die Rolle von Histonmodifikationen bei ihrer Regulation aufzuklären. Mit diesem systembiologischen Ansatz möchten wir herausfinden wie die Wirkung chromatinregulierender Komplexe integriert wird, um die Ausführung genomweiter Transkriptionsprogramme während der Entwicklung vielzelliger Organismen zu gewährleisten.

• DFG-Verfahren: Forschungsgruppen
• Teilprojekt zu: FOR 531: Chromatin Mediated Biological Decisions