Antikörper-basierte Quantifizierung spezifischer Zytostatika-DNA-Addukte in experimentellen Zellsystemen und in klinischem Probenmaterial

• Applicants: Professor Dr. Michael Linscheid; Privatdozent Dr. Jürgen Thomale
• Subject Area: Analytical Chemistry
• Term: from 2007 to 2015
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 38498505

• Final Report Year: 2015

Final Report Abstract

In der Zusammenfassung können wir festhalten, dass wir in den zurückliegen Jahren eine Vielzahl von Ergebnissen erhalten haben, die neues Licht auf die Interaktion von Cis-Platin mit DNA werfen. Die Erkenntnisse zu den durchaus komplexen Adduktspektren und den detailreichen , z.T. überraschenden Ergebnissen zur Reparatur von Crosslinks zeigen, dass wir den richtigen Ansatz und auch die richtigen Methoden entwickelt haben (z. LC/ICP MS und Isotopenverdünnung). Hinzu kommt, dass wir auch nach Auslaufen der Förderung noch weiterhin die vollständige Struktur des Antikörpers untersuchen und dazu die Sequenz der DNA bestimmt haben sowie die Proteinsequenz inclusive der Glycanstrukturen analysieren; auch die Wechselwirkung der modifizierten DNA mit dem Antikörper ist Gegenstand der Untersuchungen, und mittels nativer ESI MS konnte wir die Komplexe massenspektrometrisch sichtbar machen.

Publications

• Separation and characterization of oxaliplatin dinucleotides from DNA using HPLC-ESI ion trap mass spectrometry, Anal. Bioanal. Chem., 2008, 392(5): 819
  Mowaka, Shereen & Linscheid, Michael
  
• Chlorambucil-Adducts in DNA analyzed at the Oligonucleotide Level using HPLC-ESI MS, Chem. Res. Toxicol., 2009, 22(8): 1435
  Mohamed, Dalia; Mowaka, Shereen; Thomale, Jürgen & Linscheid, Michael W.
  
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  Oliver, Trudy G.; Mercer, Kim L.; Sayles, Leanne C.; Burke, James R.; Mendus, Diana; Lovejoy, Katherine S.; Cheng, Mei-Hsin; Subramanian, Aravind; Mu, David; Powers, Scott; Crowley, Denise; Bronson, Roderick T.; Whittaker, Charles A.; Bhutkar, Arjun; Lippard, Stephen J.; Golub, Todd; Thomale, Juergen; Jacks, Tyler & Sweet-Cordero, E. Alejandro
  
• Differential contributory roles of nucleotide excision and homologous recombination repair for enhancing cisplatin sensitivity in human ovarian cancer cells, Mol Cancer, 2011, 10, 24
  Wang, Qi-En; Milum, Keisha; Han, Chunhua; Huang, Yi-Wen; Wani, Gulzar; Thomale, Jürgen & Wani, Altaf A.
  
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  Gutekunst, Matthias; Oren, Moshe; Weilbacher, Andrea; Dengler, Michael A.; Markwardt, Christiane; Thomale, Jürgen; Aulitzky, Walter E. & van der Kuip, Heiko
  
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  Moreno-Gordaliza, Estefanía; Esteban-Fernández, Diego; Giesen, Charlotte; Lehmann, Karola; Lázaro, Alberto; Tejedor, Alberto; Scheler, Christian; Cañas, Benito; Jakubowski, Norbert; Linscheid, Michael W. & Gómez-Gómez, M. Milagros
  
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  Ziehe, Matthias; Esteban-Fernández, Diego; Hochkirch, Ulrike; Thomale, Jürgen & Linscheid, Michael W.
  
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  Mowaka, Shereen; Ziehe, Matthias; Mohamed, Dalia; Hochkirch, Ulrike; Thomale, Jürgen & Linscheid, Michael W.
  
• ERCC1 isoform expression and DNA repair in Non-Small Cell Lung Cancer, N Engl J Med, 2013, Mar 21; 368(12): 1101-10
  Friboulet, Luc; Olaussen, Ken André; Pignon, Jean-Pierre; Shepherd, Frances A.; Tsao, Ming-Sound; Graziano, Stephen; Kratzke, Robert; Douillard, Jean-Yves; Seymour, Lesley; Pirker, Robert; Filipits, Martin; André, Fabrice; Solary, Eric; Ponsonnailles, Florence; Robin, Angélique; Stoclin, Annabelle; Dorvault, Nicolas; Commo, Frédéric; Adam, Julien; ... & Soria, Jean-Charles
  
• Formation and repair kinetics of Pt-(GpG) DNA adducts in extracted circulating tumor cells and response to platinum treatment. Br J Cancer, 2013, 109:1223-9
  Nel, I; Gauler, T C; Eberhardt, W E; Nickel, A-C; Schuler, M; Thomale, J & Hoffmann, A-C
  
• PARP1 impact on DNA repair of platinum adducts: preclinical and clinical read-outs, Lung Cancer, 2013
  Olaussen, Ken A.; Adam, Julien; Vanhecke, Elsa; Vielh, Philippe; Pirker, Robert; Friboulet, Luc; Popper, Helmut; Robin, Angélique; Commo, Fréderic; Thomale, Jürgen; Kayitalire, Louis; Filipits, Martin; Le Chevalier, Thierry; André, Fabrice; Brambilla, Elisabeth & Soria, Jean-Charles