Massenspektrometer

• Subject Area: Microbiology, Virology and Immunology
• Term: Funded in 2018
• Project identifier: Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) - Project number 414761495

Der AG Bandow steht ein hochauflösendes Massenspektrometer zur Verfügung, welches zu 100% durch laufende Drittmittelprojekte ausgelastet ist (60% Proteomik/Proteinanalytik, 40% Metabolomik). Für neu eingeworbene Projekte werden dringend zusätzliche Messkapazitäten benötigt. Das beantragte Gerät soll für Metabolomik und Protein-Wirkstoff-Interaktionsstudien eingesetzt werden. Wir nutzen Metabolomik zur Identifizierung und Quantifizierung von Sekundärmetaboliten aus Kulturüberständen von Streptomyceten-Isolaten, um nach strukturell neuen Antibiotika zu suchen und die natürliche Funktion von Sekundärmetaboliten zu untersuchen. Zur Identifizierung von Antibiotika-Targets nutzen wir ein mehrschrittiges Verfahren. Zelluläre Proteine werden unter annähernd nativen Bedingungen chromatographisch getrennt, so dass Wirkstoff-Target-Komplexe intakt bleiben. Der Wirkstoffgehalt in den Elutionsfraktionen wird massenspektrometrisch bestimmt und die mit dem Wirkstoff koeluierenden Proteine stellen potentielle Targets dar. Das beantragte Gerät bietet eine hochintegrierte Systemlösung für die Metabolomik von der Probentrennung durch Flüssigkeitschromatographie über die Ionenmobilitätsspektrometrie, die daten-unabhängige Akquirierung von Massenspektren bis hin zur Datenauswertung, welche durch hohen Durchsatz, Sensitivität, Reproduzierbarkeit und komfortable bioinformatische Aufarbeitung großer Datenmengen besticht. Durch die Anschaffung werden zudem Kapazitäten für Proteom-/Protein- Analytik auf dem vorhandenen Gerät frei.

• DFG Programme: Major Research Instrumentation
• Major Instrumentation: Massenspektrometer
• Instrumentation Group: 1700 Massenspektrometer
• Applicant Institution: Ruhr-Universität Bochum
• Leader: Professorin Dr. Julia Bandow