Multi-Omics-Analyse der Auswirkungen von intra-uterinem Hitzestress während der Spätträchtigkeit bei Milchkühen auf Leistungs- und Gesundheitsparameter unter besonderer Berücksichtigung des Metaboloms und Epigenoms
Zusammenfassung der Projektergebnisse
Im Kontext des Klimawandels ist neben direktem Hitzestress (HS) besonders der intra-uterine Hitzestress (IUHS) während der Spätträchtigkeit in den Fokus von wissenschaftlichen Untersuchungen gerückt. Das Projekt zielte darauf ab, die Auswirkungen von IUHS in Kombination mit HS-Effekten auf Leistungs-, Gesundheits- und Stoffwechselparameter beim Rind mit Erweiterung auf die transgenerationale Ebene zu untersuchen. Zusätzliche zu phänotypischen Assoziationsanalysen wurden die erhobenen Kuhmerkmale mit dem Genom, dem Epigenom und dem Transkriptom in Verbindung gebracht, um die Hypothese von durch HS und IUHS induzierte phänotypische und additiv-genetische Veränderungen sowie epigenetische Effekte anhand von quantitativ-genetischen Parametern, DNA-Methylierungsmustern und Genexpressionsanalysen nachzuweisen. Für die phänotypischen, genetischen und genomischen Auswertungen des Einflusses von IUHS auf Leistungs- und Gesundheitsmerkmale standen Daten von insgesamt 172905 HF Kühen und 112000 Kälbern, von denen 19247 genotypisiert waren, zur Verfügung. Um zusätzlich den Einfluss von IUHS auf den Stoffwechsel der Nachkommen zu analysieren, wurden auf dem Versuchsstandort „Hofgut Neumühle“ Blutproben von Kühen, deren weiblichen Kälbern und Enkelinnen gezogen und zur Phänotypisierung verschiedener Blutmetaboliten durch die Biocrates Life Sciences AG herangezogen. Aufgrund von Abgängen und verlängerten Zwischenkalbezeiten konnten anstatt der theoretischen Idealkalkulation von 245 Proben final 181 Proben realisiert werden, was nach unserem Kenntnisstand dennoch ein einzigartiges Datenmaterial darstellt. Ein großer Gewinn bei der Durchführung des Projektes war die Nutzung des MxP Quant 500 Kits zur Phänotypisierung von 620 statt der ursprünglich geplanten 180 Blutmetaboliten. Die RNA der 181 Blutproben wurde durch die AG Stefan Krebs sequenziert. Die generierten Sequenzdaten standen anschließend zur Analyse von IUHS auf Methylierungsprofile von Muttertieren und Kälbern zur Verfügung. Es wurden negative Auswirkungen von IUHS auf Produktionsmerkmale, funktionale Merkmale und Metaboliten beim Nachkommen nachgewiesen. Diese Ergebnisse zeigen die Bedeutung der Umsetzung von Kühlungsmaßnahmen für Trockensteher kombiniert mit züchterischen Strategien auf Hitzetoleranz. In diesem Kontext können die identifizierten und durch HS und IUHS beeinflussten Blutmetaboliten als potenzielle Biomarker genutzt werden, welche eine frühzeitige genetische Selektion von hitzetoleranten Milchkühen ermöglichen. Die genetischen Analysen zeigten außerdem Unterschiede in den genetischen Varianzen und Heritabilitäten (direkte und maternale Komponente) von Leistungs- und funktionellen Merkmalen zwischen IUHS- und nicht IUHS-Kälbern sowie Interaktionen zwischen dem Genotyp und IUHS für funktionale Kuhmerkmale. Es konnten 31 SNP identifiziert werden, die zu signifikanten Unterschieden für Leistungsmerkmale zwischen IUHS- und nicht IUHS-Tieren im transgenerationalen Forschungsdesign beitrugen. Die epigenetischen Auswertungen ergaben mehrere Transkripte von Genen mit differenzierter Gen-Expression zwischen den IUHS-Tiergruppen. In ersten Analysen konnten auch signifikante Unterschiede in den Methylierungslevels in Bezug zu IUHS nachgewiesen werden. Das hier generierte Datenmaterial erlaubt weitergehend in möglichen Folgestudien alternative Modellierungsansätze, um die hier generierten Ergebnisse zu validieren und um die Auswirkungen von IUHS auf das Epigenom der Nachkommen noch tiefgreifender zu studieren. Die Ergebnisse des Projekts wurden in verschiedenen Fachartikeln internationaler Journale mit peer-review Prozess veröffentlicht. Die in unseren Analysen durch HS und IUHS in ihrer Konzentration beeinflussten Blutmetaboliten kommen als potenzielle Biomarker in Frage und werden in genehmigten länderübergreifenden Forschungsverbünden (Arbeitsgruppe Prof. Gengler, Belgien) ab Mitte 2023 weiterführend analysiert.
Projektbezogene Publikationen (Auswahl)
-
Across-generation effects of maternal heat stress during late gestation on production, female fertility and longevity traits in dairy cows. Journal of Dairy Research, 88(2), 147-153.
Kipp, Cordula; Brügemann, Kerstin; Zieger, Peter; Mütze, Katja; Möcklinghoff-Wicke, Sibylle; König, Sven & Halli, Kathrin
-
Genotype by heat stress interactions for production and functional traits in dairy cows from an across-generation perspective. Journal of Dairy Science, 104(9), 10029-10039.
Kipp, C.; Brügemann, K.; Yin, T.; Halli, K. & König, S.
-
Identification of candidate genes on the basis of SNP by time-lagged heat stress interactions for milk production traits in German Holstein cattle. PLOS ONE, 16(10), e0258216.
Halli, Kathrin; Vanvanhossou, Seyi Fridaius; Bohlouli, Mehdi; König, Sven & Yin, Tong
-
101. Inferring genetic parameters for prenatal heat stress effects on calf diseases and cow productivity. Proceedings of 12th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (WCGALP), 454-457. Wageningen Academic Publishers.
Yin, T.; Halli, K.; Vanvanhossou, S.F.; Bohlouli, M. & König, S.
-
Blood metabolite profiles of dairy cows and their female calves suffering from direct or intrauterine heat stress. Abstracts of the 2022 American Dairy Science Association® Annual Meeting, J. Dairy Sci. Vol 105, Supplement 1, pp. 112-113.
Halli, K., K. Brügemann, I. Cohrs, C. Koch & S. König
-
Direct genetic effects, maternal genetic effects, and maternal genetic sensitivity on prenatal heat stress for calf diseases and corresponding genomic loci in German Holsteins. Journal of Dairy Science, 105(8), 6795-6808.
Yin, T.; Halli, K. & König, S.
-
A Pilot Study on Across-Generation Impacts of Maternal Heat Stress on Blood Metabolites of Female Holstein Dairy Calves. Metabolites, 13(4), 494.
Halli, Kathrin; Cohrs, Imke; Brügemann, Kerstin; Koch, Christian & König, Sven
-
Effects of prenatal heat stress on birth weight and birth weight genetic parameters in German Holstein calves. JDS Communications, 4(6), 469-473.
Yin, T.; Halli, K. & König, S.
-
Effects of temperature-humidity index on blood metabolites of German dairy cows and their female calves. Journal of Dairy Science, 106(10), 7281-7294.
Halli, K.; Cohrs, I.; Brügemann, K.; Koch, C. & König, S.
-
Invited review: From heat stress to disease—Immune response and candidate genes involved in cattle thermotolerance. Journal of Dairy Science, 106(7), 4471-4488.
Lemal, P.; May, K.; König, S.; Schroyen, M. & Gengler, N.
